RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	INHBA	P08476	426 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CYBA	P13498	195 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CLCNKB	P51801	687 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	AP1B1	Q10567	949 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	DPYSL3	Q14195	570 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TMEM110	Q86TL2	294 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	URGCP	Q8TCY9	931 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	DUSP16	Q9BY84	665 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		10.16	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ARL5C	A6NH57	179 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TGM2	P21980	687 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PTPN7	P35236	360 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ARPP19	P56211	112 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	TRPV1	Q8NER1	839 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PLXNB2	O15031	1838 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ZBTB6	Q15916	424 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PEBP4	Q96S96	227 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	DDIT4	Q9NX09	232 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
LIAS-222	ENST00000640888	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	SKI	P12755	728 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	KLRC2	P26717	231 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	GDF10	P55107	478 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	OSTM1	Q86WC4	334 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	USP6NL	Q92738	828 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		10.15	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	AOC2	O75106	756 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	SPAG7	O75391	227 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	BANF1	O75531	89 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	FAM107A	O95990	144 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	CA4	P22748	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	AMPD1	P23109	780 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	RBL1	P28749	1068 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	NR1H3	Q13133	447 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	RAB6C	Q53S08	254 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	SMAP	O00193	183 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	FBXO21	O94952	628 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	PFKM	P08237	780 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	GRIK1	P39086	918 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	MATK	P42679	507 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	OR1G1	P47890	313 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	TPI1	P60174	286 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	IL9R	Q01113	521 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	CA9	Q16790	459 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	FAM35A	Q86V20	835 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	TEKT4	Q8WW24	435 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LIAS-222	ENST00000640888	PTGES	O14684	152 aa		10.14	□□□□□ -0.79

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