RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPS100	YHR139C	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPS100	YHR139C	FYV12	Q08559	129 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPS100	YHR139C	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPS100	YHR139C	YLR255C	O13574	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPS100	YHR139C	YHR125W	P38831	101 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPS100	YHR139C	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPS100	YHR139C	COX8	P04039	78 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPS100	YHR139C	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPS100	YHR139C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPS100	YHR139C	TOM6	P33448	61 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPS100	YHR139C	YBR016W	P38216	128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPS100	YHR139C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPS100	YHR139C	YJL009W	P47078	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPS100	YHR139C	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPS100	YHR139C	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPS100	YHR139C	YGL034C	P53186	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPS100	YHR139C	OLI1	P61829	76 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPS100	YHR139C	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPS100	YHR139C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPS100	YHR139C	SDH6	Q3E785	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPS100	YHR139C	OST5	Q92316	86 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPS100	YHR139C	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SPS100	YHR139C	YDR210W	Q03482	75 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SPS100	YHR139C	MRX7	P53869	86 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPS100	YHR139C	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SPS100	YHR139C	HUB1	Q6Q546	73 aa		4.44	□□□□□ -1.7
SPS100	YHR139C	YML054C-A	Q3E809	52 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SPS100	YHR139C	YBL044W	P38194	122 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SPS100	YHR139C	YMR122C	Q03879	124 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPS100	YHR139C	YOR394C-A	Q8TGJ0	55 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SPS100	YHR139C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPS100	YHR139C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SPS100	YHR139C	ATP17	Q06405	101 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPS100	YHR139C	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPS100	YHR139C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPS100	YHR139C	YCR108C	Q3E819	63 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SPS100	YHR139C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
SPS100	YHR139C	SBH1	P52870	82 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SPS100	YHR139C	YEL014C	P39999	101 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SPS100	YHR139C	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SPS100	YHR139C	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SPS100	YHR139C	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPS100	YHR139C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPS100	YHR139C	QCR10	P37299	77 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SPS100	YHR139C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SPS100	YHR139C	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SPS100	YHR139C	HHY1	P39982	102 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SPS100	YHR139C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPS100	YHR139C	SOM1	Q05676	74 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SPS100	YHR139C	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SPS100	YHR139C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SPS100	YHR139C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SPS100	YHR139C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SPS100	YHR139C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SPS100	YHR139C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SPS100	YHR139C	YHR050W-A	Q05451	56 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPS100	YHR139C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPS100	YHR139C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SPS100	YHR139C	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		2.57	□□□□□ -2
SPS100	YHR139C	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SPS100	YHR139C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		2.3	□□□□□ -2.04
SPS100	YHR139C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		2.07	□□□□□ -2.08

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