RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W YJR128WP47162 119 aa5.07□□□□□ -1.6
DDI1YER143W HHF1P02309 103 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
DDI1YER143W YHR125WP38831 101 aa5.01□□□□□ -1.61
DDI1YER143W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
DDI1YER143W YLR255CO13574 117 aa4.98□□□□□ -1.61
DDI1YER143W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa4.97□□□□□ -1.61
DDI1YER143W YJL144WP47009 104 aa4.96□□□□□ -1.62
DDI1YER143W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
DDI1YER143W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
DDI1YER143W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa4.91□□□□□ -1.62
DDI1YER143W YBR016WP38216 128 aa4.9□□□□□ -1.63
DDI1YER143W COX8P04039 78 aa4.89□□□□□ -1.63
DDI1YER143W YBL008W-AQ3E821 79 aa4.87□□□□□ -1.63
DDI1YER143W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa4.87□□□□□ -1.63
DDI1YER143W SDH6Q3E785 79 aa4.85□□□□□ -1.63
DDI1YER143W YIR021W-AQ3E739 70 aa4.8□□□□□ -1.64
DDI1YER143W OLI1P61829 76 aa4.77□□□□□ -1.65
DDI1YER143W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa4.77□□□□□ -1.65
DDI1YER143W FYV12Q08559 129 aa4.76□□□□□ -1.65
DDI1YER143W Q0017Q9ZZX8 53 aa4.76□□□□□ -1.65
DDI1YER143W OST5Q92316 86 aa4.75□□□□□ -1.65
DDI1YER143W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa4.74□□□□□ -1.65
DDI1YER143W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa4.73□□□□□ -1.65
DDI1YER143W YJL009WP47078 108 aa4.69□□□□□ -1.66
DDI1YER143W MRX7P53869 86 aa4.69□□□□□ -1.66
DDI1YER143W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
DDI1YER143W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
DDI1YER143W HUB1Q6Q546 73 aa4.67□□□□□ -1.66
DDI1YER143W YGL034CP53186 121 aa4.62□□□□□ -1.67
DDI1YER143W YMR122CQ03879 124 aa4.62□□□□□ -1.67
DDI1YER143W YBR121C-AP0C5L4 52 aa4.6□□□□□ -1.67
DDI1YER143W YOR381W-AQ3E804 55 aa4.59□□□□□ -1.67
DDI1YER143W YDR210WQ03482 75 aa4.57□□□□□ -1.68
DDI1YER143W YBL044WP38194 122 aa4.52□□□□□ -1.69
DDI1YER143W YER188C-AP0C0V2 99 aa4.5□□□□□ -1.69
DDI1YER143W SBH1P52870 82 aa4.48□□□□□ -1.69
DDI1YER143W YML054C-AQ3E809 52 aa4.47□□□□□ -1.69
DDI1YER143W YCR095W-AQ3E787 52 aa4.45□□□□□ -1.7
DDI1YER143W YLR412C-AQ3E742 68 aa4.43□□□□□ -1.7
DDI1YER143W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa4.41□□□□□ -1.7
DDI1YER143W YER175W-AQ8TGU4 54 aa4.4□□□□□ -1.71
DDI1YER143W ATP17Q06405 101 aa4.38□□□□□ -1.71
DDI1YER143W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa4.33□□□□□ -1.72
DDI1YER143W YCR108CQ3E819 63 aa4.28□□□□□ -1.72
DDI1YER143W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
DDI1YER143W YEL014CP39999 101 aa4.2□□□□□ -1.74
DDI1YER143W QCR10P37299 77 aa4.09□□□□□ -1.75
DDI1YER143W YOR072W-BQ3E832 53 aa4□□□□□ -1.77
DDI1YER143W YML100W-AQ8TGT0 57 aa4□□□□□ -1.77
DDI1YER143W YGL014C-AP0C5N1 53 aa3.97□□□□□ -1.77
DDI1YER143W YOR376W-AQ3E805 51 aa3.95□□□□□ -1.78
DDI1YER143W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
DDI1YER143W SOM1Q05676 74 aa3.81□□□□□ -1.8
DDI1YER143W HHY1P39982 102 aa3.79□□□□□ -1.8
DDI1YER143W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
DDI1YER143W YBR072C-AQ3E794 53 aa3.67□□□□□ -1.82
DDI1YER143W YER078W-AQ3E7A2 54 aa3.55□□□□□ -1.84
DDI1YER143W YHR050W-AQ05451 56 aa3.27□□□□□ -1.89
DDI1YER143W YHR032W-AP0C5N6 59 aa3.22□□□□□ -1.89
DDI1YER143W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa3.04□□□□□ -1.92
DDI1YER143W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa2.77□□□□□ -1.97
DDI1YER143W YLR157W-EP0CF00 54 aa2.59□□□□□ -1.99
DDI1YER143W YHR086W-AQ3E746 53 aa2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.7 ms