RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 YAR064WP39563 99 aa6.5□□□□□ -1.37
RDN25-2RDN25-2 YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa6.49□□□□□ -1.37
RDN25-2RDN25-2 YHR007C-AQ07074 71 aa6.49□□□□□ -1.37
RDN25-2RDN25-2 YCR043CP25361 127 aa6.48□□□□□ -1.37
RDN25-2RDN25-2 YCL042WP25572 119 aa6.48□□□□□ -1.37
RDN25-2RDN25-2 CUP1-1P0CX80 61 aa6.46□□□□□ -1.38
RDN25-2RDN25-2 CUP1-2P0CX81 61 aa6.46□□□□□ -1.38
RDN25-2RDN25-2 RTC6O14464 93 aa6.46□□□□□ -1.38
RDN25-2RDN25-2 YLR307C-AQ3E825 87 aa6.41□□□□□ -1.38
RDN25-2RDN25-2 YMR230W-AQ3E7B5 62 aa6.4□□□□□ -1.38
RDN25-2RDN25-2 DDR2P89113 61 aa6.39□□□□□ -1.39
RDN25-2RDN25-2 YGL014C-AP0C5N1 53 aa6.38□□□□□ -1.39
RDN25-2RDN25-2 GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data6.38□□□□□ -1.39not detected
RDN25-2RDN25-2 MRP10O75012 95 aa6.35□□□□□ -1.39
RDN25-2RDN25-2 YOR072WQ08486 104 aa6.34□□□□□ -1.39
RDN25-2RDN25-2 YLR122CQ12312 125 aa6.32□□□□□ -1.4
RDN25-2RDN25-2 YJL197C-AP0C5P0 93 aa6.29□□□□□ -1.4
RDN25-2RDN25-2 YPR195CQ06594 109 aa6.29□□□□□ -1.4
RDN25-2RDN25-2 YGL041C-BQ3E750 60 aa6.28□□□□□ -1.4
RDN25-2RDN25-2 YJR128WP47162 119 aa6.24□□□□□ -1.41
RDN25-2RDN25-2 YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa6.24□□□□□ -1.41
RDN25-2RDN25-2 YDL012CQ12489 107 aa6.23□□□□□ -1.41
RDN25-2RDN25-2 YBL008W-AQ3E821 79 aa6.23□□□□□ -1.41
RDN25-2RDN25-2 YDR034C-AP0C289 58 aa6.2□□□□□ -1.42
RDN25-2RDN25-2 YEL014CP39999 101 aa6.18□□□□□ -1.42
RDN25-2RDN25-2 YER078W-AQ3E7A2 54 aa6.18□□□□□ -1.42
RDN25-2RDN25-2 CMC4Q3E7A9 73 aa6.17□□□□□ -1.42
RDN25-2RDN25-2 YDR210WQ03482 75 aa6.08□□□□□ -1.44
RDN25-2RDN25-2 YGR146C-AQ8TGT9 53 aa6.05□□□□□ -1.44
RDN25-2RDN25-2 COX8P04039 78 aa6.03□□□□□ -1.44
RDN25-2RDN25-2 DYN1P36022 4092 aa6□□□□□ -1.45
RDN25-2RDN25-2 YBL044WP38194 122 aa6□□□□□ -1.45
RDN25-2RDN25-2 YLR255CO13574 117 aa6□□□□□ -1.45
RDN25-2RDN25-2 YCR108CQ3E819 63 aa5.99□□□□□ -1.45
RDN25-2RDN25-2 YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa5.95□□□□□ -1.46
RDN25-2RDN25-2 YJL144WP47009 104 aa5.93□□□□□ -1.46
RDN25-2RDN25-2 OLI1P61829 76 aa5.92□□□□□ -1.46
RDN25-2RDN25-2 YJR085CP47131 105 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RDN25-2RDN25-2 YOR316C-AQ3E806 69 aa5.91□□□□□ -1.46
RDN25-2RDN25-2 YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa5.91□□□□□ -1.46
RDN25-2RDN25-2 YER175W-AQ8TGU4 54 aa5.89□□□□□ -1.47
RDN25-2RDN25-2 RPL37BP51402 88 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RDN25-2RDN25-2 LCL1Q02786 101 aa5.82□□□□□ -1.48
RDN25-2RDN25-2 YBR016WP38216 128 aa5.74□□□□□ -1.49
RDN25-2RDN25-2 YHR073W-AP0C5N7 58 aa5.73□□□□□ -1.49
RDN25-2RDN25-2 YHR032W-AP0C5N6 59 aa5.65□□□□□ -1.5
RDN25-2RDN25-2 COX7P10174 60 aa5.65□□□□□ -1.5
RDN25-2RDN25-2 YFL067WP43537 175 aa5.53□□□□□ -1.52
RDN25-2RDN25-2 HHY1P39982 102 aa5.41□□□□□ -1.54
RDN25-2RDN25-2 YJL009WP47078 108 aa5.36□□□□□ -1.55
RDN25-2RDN25-2 YAL067W-AQ8TGK6 75 aa5.34□□□□□ -1.55
RDN25-2RDN25-2 RPL37AP49166 88 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
RDN25-2RDN25-2 YBR072C-AQ3E794 53 aa5.21□□□□□ -1.57
RDN25-2RDN25-2 YOR072W-BQ3E832 53 aa5.19□□□□□ -1.58
RDN25-2RDN25-2 MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RDN25-2RDN25-2 Q0017Q9ZZX8 53 aa4.84□□□□□ -1.63
RDN25-2RDN25-2 YML054C-AQ3E809 52 aa4.83□□□□□ -1.64
RDN25-2RDN25-2 YOL164W-AQ3E7A5 60 aa4.8□□□□□ -1.64
RDN25-2RDN25-2 YHR086W-AQ3E746 53 aa4.23□□□□□ -1.73
RDN25-2RDN25-2 YLR157W-EP0CF00 54 aa4.06□□□□□ -1.76
RDN25-2RDN25-2 YHR050W-AQ05451 56 aa3.99□□□□□ -1.77
RDN25-2RDN25-2 RPS29BP41058 56 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RDN25-2RDN25-2 RPS29AP41057 56 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
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