RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484134.5

RPUSD3-216, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 2,491 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-216ENST00000484134 STBD1O95210 358 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 ICAM1P05362 532 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PYGLP06737 847 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PTGER2P43116 358 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 MTMR2Q13614 643 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 DPYSL3Q14195 570 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 BBS12Q6ZW61 710 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 FAM160B2Q86V87 743 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 C7orf26Q96N11 449 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PLLPQ9Y342 182 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 EP400Q96L91 3159 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 A0A088AWK7 358 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 CALB1P05937 261 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 LIG4P49917 911 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 TMPRSS15P98073 1019 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 LRRC36Q1X8D7 754 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 TEX44Q53QW1 395 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 IRF6O14896 467 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PLA2G6O60733 806 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 TSHRP16473 764 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 CPOXP36551 454 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 CAP2P40123 477 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 GRIA2P42262 883 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 JAK3P52333 1124 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PDE1BQ01064 536 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 CHI3L2Q15782 390 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 ZNF394Q53GI3 561 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 CPXCR1Q8N123 301 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 EBF4Q9BQW3 602 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 FEM1BQ9UK73 627 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 E2F7Q96AV8 911 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 GPAMQ9HCL2 828 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 I3L4J1 428 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 LRCH4O75427 683 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 WEE2P0C1S8 567 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 KDELR1P24390 212 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PGM5Q15124 567 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 TAF5Q15542 800 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 SEZ6Q53EL9 994 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 SFT2D3Q587I9 215 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 UBR7Q8N806 425 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 PPM1NQ8N819 430 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 C8orf37Q96NL8 207 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 HAPLN3Q96S86 360 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.58■□□□□ 0.89
RPUSD3-216ENST00000484134 UGT1A9O60656 530 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 CFAP157Q5JU67 520 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 PDSS2Q86YH6 399 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 CFAP36Q96G28 342 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 WDR81Q562E7 1941 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 SLC25A3Q00325 362 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 LSAMPQ13449 338 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 TAZQ16635 292 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 LPCAT4Q643R3 524 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.57■□□□□ 0.88
RPUSD3-216ENST00000484134 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms