RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	LILRB3	O75022	631 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	GABBR2	O75899	941 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	MMP8	P22894	467 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	BDNF	P23560	247 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	BCAT1	P54687	386 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	PDCL	Q13371	301 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	PTPN14	Q15678	1187 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	KIAA1328	Q86T90	577 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	KCNK16	Q96T55	309 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	SMO	Q99835	787 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	DUSP16	Q9BY84	665 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	KCND1	Q9NSA2	647 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	CEP83	Q9Y592	693 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	WDR27	A2RRH5	827 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	AP1G2	O75843	785 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	CSPG5	O95196	566 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	UROD	P06132	367 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	CPB1	P15086	417 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	OR1D2	P34982	312 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	RGS7	P49802	495 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	ERVFC1	P60507	584 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	ROR1	Q01973	937 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	H2AFV	Q71UI9	128 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	CERS4	Q9HA82	394 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		18.77	■□□□□ 0.6
SPIN3-238	ENST00000640421	PIK3R2	O00459	728 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GRM6	O15303	877 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CTSA	P10619	480 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	NPR3	P17342	541 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CYP2F1	P24903	491 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ERVK-21	P61565	698 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GPR17	Q13304	367 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CAMK1	Q14012	370 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		18.76	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MTMR11	A4FU01	709 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ANKRD62	A6NC57	917 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PJA2	O43164	708 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM200B	P0CF97	657 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MAP3K7CL	P57077	242 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	POF1B	Q8WVV4	589 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	LZTS1	Q9Y250	596 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ZSCAN12	O43309	604 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ERBB2	P04626	1255 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM253	P0C7T8	217 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SETSIP	P0DME0	302 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PIGZ	Q86VD9	579 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TCF25	Q9BQ70	676 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ST7	Q9NRC1	585 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	INTU	Q9ULD6	942 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ATP8B3	O60423	1300 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		18.75	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421		E5RJQ4	531 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TEX28	O15482	410 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	RB1	P06400	928 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	RRM1	P23921	792 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	PLA2G4A	P47712	749 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	TMC7	Q7Z402	723 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ERICH1	Q86X53	443 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF653	Q96CK0	615 aa		18.74	■□□□□ 0.59
SPIN3-238	ENST00000640421	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59

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