RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 TMC2Q8TDI7 906 aa22.95■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 C5orf42Q9H799 3197 aa22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 GTF2H1P32780 548 aa22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 C2orf54Q08AI8 447 aa22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ADAM15Q13444 863 aa22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 EFHBQ8N7U6 833 aa22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 NCANO14594 1321 aa22.94■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 LINC01565O15544 149 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CTSAP10619 480 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 GARTP22102 1010 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 MXI1P50539 228 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ZBP1Q9H171 429 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 MARCH5Q9NX47 278 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 FTCDO95954 541 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 PIGRP01833 764 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ADRB2P07550 413 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM253P0C7T8 217 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CXCR5P32302 372 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 KYAT1Q16773 422 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 DUSP6Q16828 381 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 USP37Q86T82 979 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.93■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 F8W810 466 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 C2CD2LO14523 706 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CLTAP09496 248 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 GCLMP48507 274 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 COL19A1Q14993 1142 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 PBKQ96KB5 322 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.92■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SOD2P04179 222 aa22.91■■□□□ 1.26
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SGMS1-210ENST00000619438 BMP1P13497 986 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 LTBRP36941 435 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 GALCP54803 685 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 GPS2Q13227 327 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CASP8Q14790 479 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 RPS6KA1Q15418 735 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CLUL1Q15846 466 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SNX27Q96L92 541 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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SGMS1-210ENST00000619438 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.91■■□□□ 1.26
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SGMS1-210ENST00000619438 KIF4AO95239 1232 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 URODP06132 367 aa22.9■■□□□ 1.26
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 KRT39Q6A163 491 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 HASPINQ8TF76 798 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 RFFLQ8WZ73 363 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 TAF4BQ92750 862 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 PSMB7Q99436 277 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 IRAK3Q9Y616 596 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 A0A0B4J269 797 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 B3GAT3O94766 335 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 TNFAIP3P21580 790 aa22.9■■□□□ 1.26
SGMS1-210ENST00000619438 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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