RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527352.1

C11orf80-208, Transcript of chromosome 11 open reading frame 80, human

TSL 3

Gene C11orf80, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C11orf80-208	ENST00000527352	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	ABCC11	Q96J66	1382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	BTN3A1	O00481	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	STC2	O76061	302 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	SASH1	O94885	1247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	IL2RB	P14784	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	PI3	P19957	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	FGFR2	P21802	821 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	ADCY7	P51828	1080 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	KCNN1	Q92952	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	MAF1	Q9H063	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
C11orf80-208	ENST00000527352	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	MTSS1	O43312	755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	ABHD16A	O95870	558 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	IL1R1	P14778	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	GRK6	P43250	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	RAP2B	P61225	183 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	APBA1	Q02410	837 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	CREM	Q03060	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	HGFAC	Q04756	655 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	SP140	Q13342	867 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	CTBP1	Q13363	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	BIRC3	Q13489	604 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	SNX22	Q96L94	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.83	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.82	□□□□□ -1.64
C11orf80-208	ENST00000527352	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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