RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TC2NQ8N9U0 490 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 C2CD2LO14523 706 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBED6P86452 979 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TAP1Q03518 808 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 AUTS2Q8WXX7 1259 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 AAASQ9NRG9 546 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.29■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAPPC3O43617 180 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP2C2O75185 946 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 CILPO75339 1184 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 SKILP12757 684 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 SOX5P35711 763 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM14Q14142 442 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM209Q96SK2 561 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX25Q9H3E2 840 aa24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 A8MXQ7 604 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TPM1P09493 284 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 RFX1P22670 979 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJB2P25686 324 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 TACC1O75410 805 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 EFEMP2O95967 443 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 CLCN1P35523 988 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 STAT1P42224 750 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 DPH6Q7L8W6 267 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ACOT1Q86TX2 421 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf29Q8N999 325 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.27■■□□□ 1.48
TSNARE1-208ENST00000524325 FGFR3P22607 806 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 RAD23BP54727 409 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 INCA1Q0VD86 236 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 VPS52Q8N1B4 723 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 MSRAQ9UJ68 235 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.26■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 GABRDO14764 452 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 TTPALQ9BTX7 342 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP11A1P05108 521 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4Q2P0C623 313 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL17P18621 184 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJB1P25685 340 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 METTL23Q86XA0 190 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.25■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 PPM1AP35813 382 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF132P52740 706 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ASIC2Q16515 512 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR59Q6PJI9 974 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 CNGA4Q8IV77 575 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM81BQ96LP2 452 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC7Q99615 494 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.24■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 TYMPP19971 482 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT17Q04695 432 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 USP41Q3LFD5 358 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 TAF3Q5VWG9 929 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA1841Q6NSI8 718 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 TFAP2BQ92481 460 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.23■■□□□ 1.47
TSNARE1-208ENST00000524325 NT5C1AQ9BXI3 368 aa24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms