RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 WNT7BP56706 349 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 MGAT5BQ3V5L5 792 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 WSCD1Q658N2 575 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ZNF560Q96MR9 790 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 BCO2Q9BYV7 579 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 HEBP1Q9NRV9 189 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 PRR23AA6NEV1 266 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 KPNA7A9QM74 516 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 CUTAO60888 179 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 YEATS4O95619 227 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ITGB3P05106 788 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 GLULP15104 373 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 AGAP1Q9UPQ3 857 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 EXTL3O43909 919 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 KRT19P08727 400 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 GDI1P31150 447 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ASIC1P78348 528 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 VITQ6UXI7 678 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ITIH5Q86UX2 942 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 TMC8Q8IU68 726 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 C1orf210Q8IVY1 113 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 GLIS3Q8NEA6 775 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 LTB4R2Q9NPC1 389 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 PSMC3P17980 439 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 PNPLA4P41247 253 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 AMPD3Q01432 767 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 VEPH1Q14D04 833 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 E2F4Q16254 413 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 SHC4Q6S5L8 630 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ZNF852Q6ZMS4 543 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 C1orf127Q8N9H9 656 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 IQUBQ8NA54 791 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 DNASE1L2Q92874 299 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 PSMG2Q969U7 264 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 FAM84AQ96KN4 292 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 LRRC3Q9BY71 257 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 TRIM9Q9C026 710 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 GPR88Q9GZN0 384 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ATXN3LQ9H3M9 355 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 CUEDC2Q9H467 287 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ASB3Q9Y575 518 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 R4GN57 208 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 GABRR2P28476 465 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 TUFMP49411 452 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 BFSP1Q12934 665 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 TAF12Q16514 161 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 YAF2Q8IY57 180 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 GPD1LQ8N335 351 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 IRF7Q92985 503 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 BORCS6Q96GS4 357 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 HEPACAM2A8MVW5 462 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ZNF263O14978 683 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 F13A1P00488 732 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 ME1P48163 572 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 GIPC2Q8TF65 315 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 MTMR12Q9C0I1 747 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 FAM186AA6NE01 2351 aa23.45■■□□□ 1.35
TTC28-204ENST00000468807 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 FGF19O95750 216 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 TSPY1Q01534 308 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-204ENST00000468807 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms