RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTEN-204ENST00000487939 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTEN-204ENST00000487939 SCAMP4Q969E2 229 aa5.66□□□□□ -1.5
PTEN-204ENST00000487939 SLC35A4Q96G79 324 aa5.66□□□□□ -1.5
PTEN-204ENST00000487939 BOD1Q96IK1 185 aa5.66□□□□□ -1.5
PTEN-204ENST00000487939 SIK2Q9H0K1 926 aa5.66□□□□□ -1.5
PTEN-204ENST00000487939 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.66□□□□□ -1.5
PTEN-204ENST00000487939 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.66□□□□□ -1.5
PTEN-204ENST00000487939 HS3ST4Q9Y661 456 aa5.66□□□□□ -1.5
PTEN-204ENST00000487939 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTEN-204ENST00000487939 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTEN-204ENST00000487939 UNC119BA6NIH7 251 aa5.62□□□□□ -1.51
PTEN-204ENST00000487939 FAM227AF5H4B4 570 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTEN-204ENST00000487939 TUSC2O75896 110 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTEN-204ENST00000487939 GPSM2P81274 684 aa5.62□□□□□ -1.51
PTEN-204ENST00000487939 CYP2A13Q16696 494 aa5.62□□□□□ -1.51
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