RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555653.1

MIS18BP1-211, Transcript of MIS18 binding protein 1, human

TSL 2

Gene MIS18BP1, Length 429 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIS18BP1-211	ENST00000555653	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LENG9	Q96B70	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653		A0A088AWK7	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	AMY1A	P04745	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ALDH2	P05091	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ALAS1	P13196	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FGL2	Q14314	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM83A	Q86UY5	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HAS1	Q92839	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TPP1	O14773	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FRS3	O43559	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MGEA5	O60502	916 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MFAP3L	O75121	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GC	P02774	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RAP2A	P10114	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TYR	P14679	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RHCE	P18577	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ATP5J	P18859	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GNAT2	P19087	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MAL	P21145	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MGAT1	P26572	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CLRN1	P58418	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RHD	Q02161	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653		H3BUI4	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GOLIM4	O00461	696 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GNAI3	P08754	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PTGS2	P35354	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	USP14	P54578	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RAB1A	P62820	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GNAI1	P63096	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM189B	P81408	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PICALM	Q13492	652 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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