RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	DENND1C	Q8IV53	801 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	HAS1	Q92839	578 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	LENG9	Q96B70	501 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FZD1	Q9UP38	647 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PLIN1	O60240	522 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF202	O95125	648 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GNAI3	P08754	354 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CKB	P12277	381 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MAL	P21145	153 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GNAI1	P63096	354 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	DGCR2	P98153	550 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ZXDA	P98168	799 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ABHD18	Q0P651	414 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	NOG	Q13253	232 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MAP9	Q49MG5	647 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	KSR2	Q6VAB6	950 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	TTC17	Q96AE7	1141 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	TIFA	Q96CG3	184 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	WDCP	Q9H6R7	721 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	JKAMP	Q9P055	326 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	SLC43A1	O75387	559 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	TUSC2	O75896	110 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	UBXN7	O94888	489 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	ANXA1	P04083	346 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM27	P14373	513 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	HK3	P52790	923 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC157	Q569K6	752 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	METRNL	Q641Q3	311 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF365	Q70YC5	407 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	PNKP	Q96T60	521 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	RLIM	Q9NVW2	624 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	RNF181	Q9P0P0	153 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1B0GTW7	788 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF185	O15231	689 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	NCR1	O76036	304 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	ALDH2	P05091	517 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	CFI	P05156	583 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	ADH4	P08319	380 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	MYB	P10242	640 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	SLC6A2	P23975	617 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	BMPR1A	P36894	532 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	GDF5	P43026	501 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	MAP2K6	P52564	334 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	SNAPC2	Q13487	334 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	MED15	Q96RN5	788 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	NEU1	Q99519	415 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	CGRRF1	Q99675	332 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	SARG	Q9BW04	601 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	F2RL2	O00254	374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CLK1-208	ENST00000464454	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58

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