RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	KAT5	Q92993	513 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	DRGX	A6NNA5	263 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PLSCR1	O15162	318 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PTGS2	P35354	604 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SYNE4	Q8N205	404 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF276	Q8N554	614 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	RUNDC1	Q96C34	613 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	TAAR9	Q96RI9	348 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF747	Q9BV97	191 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	LEFTY2	O00292	366 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	WNT10B	O00744	389 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FAM20B	O75063	409 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	HAUS5	O94927	633 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	TACR2	P21452	398 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CHN2	P52757	468 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MXRA7	P84157	204 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	TLE1	Q04724	770 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GBX1	Q14549	363 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CSRP2	Q16527	193 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PGS1	Q32NB8	556 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MED25	Q71SY5	747 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SYT12	Q8IV01	421 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	C3orf20	Q8ND61	904 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MYL1	P05976	194 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CD1A	P06126	327 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	HLA-DOA	P06340	250 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	IL12RB1	P42701	662 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	DSC2	Q02487	901 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	USP51	Q70EK9	711 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GGN	Q86UU5	652 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	RGMA	Q96B86	450 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FAM167A	Q96KS9	214 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MYOC	Q99972	504 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	AHRR	A9YTQ3	701 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454		H3BML4	177 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GRM6	O15303	877 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FZD7	O75084	574 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	RPS6KA4	O75676	772 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ITGB1	P05556	798 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	C6	P13671	934 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	LAG3	P18627	525 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MAK	P20794	623 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GCSH	P23434	173 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SMARCA1	P28370	1054 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	MCM7	P33993	719 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A3	Q00325	362 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CLK1-208	ENST00000464454	GRM3	Q14832	879 aa		5.23	□□□□□ -1.57

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