RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ECT2Q9H8V3 914 aa18.62■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa18.62■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ASAP2O43150 1006 aa18.62■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 PAMP19021 973 aa18.62■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 CDR2Q01850 454 aa18.62■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 LONRF1Q17RB8 773 aa18.62■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 FSCBQ5H9T9 825 aa18.62■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.62■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 PHF20L1A8MW92 1017 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 GIT2Q14161 759 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 62.8
SCARB2-201ENST00000264896 SLC13A1Q9BZW2 595 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 GRAMD1BQ3KR37 738 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 TTC1Q99614 292 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ASB14A6NK59 587 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 COPS2P61201 443 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 RPS6P62753 249 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 NOP14P78316 857 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 RPAINQ86UA6 219 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 MICALL2Q8IY33 904 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 SCFD1Q8WVM8 642 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 CASP4P49662 377 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 PMS1P54277 932 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF677Q86XU0 584 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ANKMY2Q8IV38 441 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 SPDL1Q96EA4 605 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 SGSM3Q96HU1 749 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 THAP2Q9H0W7 228 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 THEGQ9P2T0 379 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 NEU2Q9Y3R4 380 aa18.61■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 SEC24CP53992 1094 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 KYNUQ16719 465 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 EFHC2Q5JST6 749 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 HIPK4Q8NE63 616 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 PDGFRAP16234 1089 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 TAC1P20366 129 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 MUTP22033 750 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA1841Q6NSI8 718 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 RDM1Q8NG50 284 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ACAP3Q96P50 834 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 AGAP1Q9UPQ3 857 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 DCCP43146 1447 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM66O15016 1216 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 OCRLQ01968 901 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 CFAP69A5D8W1 941 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 MYL3P08590 195 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 KITP10721 976 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ADORA2BP29275 332 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 STYK1Q6J9G0 422 aa18.6■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 FAM107AO95990 144 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 HSD17B3P37058 310 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 SLC29A2Q14542 456 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 MCEEQ96PE7 176 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 APOL1O14791 398 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 STILQ15468 1287 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 ACER1Q8TDN7 264 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 EHD4Q9H223 541 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 A0A087X0B3 334 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 TYK2P29597 1187 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 RFC5P40937 340 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA0895Q8NCT3 520 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 H3BRJ5 948 aa18.58■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 EXTL3O43909 919 aa18.58■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 EPC2Q52LR7 807 aa18.58■□□□□ 0.57
SCARB2-201ENST00000264896 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms