RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 SAAL1Q96ER3 474 aa22.92■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 TMEM169Q96HH4 297 aa22.92■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.92■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.92■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.92■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 LZTS1Q9Y250 596 aa22.92■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 KINO60870 393 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 ALDH2P05091 517 aa22.91■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 SPAG1Q07617 926 aa22.91■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 KCNB1Q14721 858 aa22.91■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.91■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.91■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 TLR9Q9NR96 1032 aa22.91■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 CARNS1A5YM72 827 aa22.9■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 LACTBL1A8MY62 500 aa22.9■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 ADRB2P07550 413 aa22.9■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 KRT17Q04695 432 aa22.9■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.9■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.9■■□□□ 1.26
COX5B-201ENST00000258424 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 FSCN2O14926 492 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 SPATA20Q8TB22 786 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.89■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 VWA8A3KMH1 1905 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 NCK2O43639 380 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 KIF4AO95239 1232 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 EFEMP2O95967 443 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 WNT7BP56706 349 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 HASPINQ8TF76 798 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 FAM212AQ96EL1 285 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 TCF25Q9BQ70 676 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CLIC2O15247 247 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 NFICP08651 508 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CLCNKBP51801 687 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 VPS52Q8N1B4 723 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 KIF12Q96FN5 646 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GBP4Q96PP9 640 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 ZBP1Q9H171 429 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.87■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 EXTL3O43909 919 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB6Q15916 424 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 UPP1Q16831 310 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 JADE1Q6IE81 842 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GPD1LQ8N335 351 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 SMARCE1Q969G3 411 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GSDMAQ96QA5 445 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CLDND1Q9NY35 253 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.86■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 SMC2O95347 1197 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 IL9P15248 144 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GUCY2FP51841 1108 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 COL19A1Q14993 1142 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 FUT10Q6P4F1 479 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 TMC7Q7Z402 723 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 CD302Q8IX05 232 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 GJD3Q8N144 294 aa22.85■■□□□ 1.25
COX5B-201ENST00000258424 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.85■■□□□ 1.25
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