RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8MH3BSY2 632 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PFDN1O60925 122 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GLI1P08151 1106 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CYBAP13498 195 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJB1P25685 340 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK8P49336 464 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 OAZ1P54368 228 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 KLC1Q07866 573 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC3L1Q86VI1 746 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SPICE1Q8N0Z3 855 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PGBD3Q8N328 593 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 IPMKQ8NFU5 416 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 STK32AQ8WU08 396 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 BADQ92934 168 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 OSBP2Q969R2 916 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 KIFC2Q96AC6 838 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF653Q96CK0 615 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NRBF2Q96F24 287 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM161BQ96MY7 647 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM129AQ9BZQ8 928 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ACAD9Q9H845 621 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ECHDC1Q9NTX5 307 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SATB2Q9UPW6 733 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CFL2Q9Y281 166 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PFASO15067 1338 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 UTRNP46939 3433 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK2AP1O14519 115 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TMCC2O75069 709 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LARGE1O95461 756 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC192P0DO97 292 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 S100A1P23297 94 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SHMT1P34896 483 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 E2F2Q14209 437 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 WSCD2Q2TBF2 565 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GNASQ5JWF2 1037 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP85Q6P2H3 762 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP128Q6ZU80 1094 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM200AQ8TCP9 573 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TIFAQ96CG3 184 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SAMD11Q96NU1 681 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KATNAL1Q9BW62 490 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NYAP2Q9P242 653 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF69Q9UC07 566 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DOCK2Q92608 1830 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 STMND1H3BQB6 276 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 HAT1O14929 419 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TTLL1O95922 423 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 EEF2P13639 858 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 IGFBP4P22692 258 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC1A4P43007 532 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 BLVRAP53004 296 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CAP1Q01518 475 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 STK3Q13188 491 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 STIM1Q13586 685 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LHX8Q68G74 356 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DGKHQ86XP1 1220 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FSD1Q9BTV5 496 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPN10Q9HC96 672 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC171Q6TFL3 1326 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPAN6O43657 245 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 EXTL3O43909 919 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FGBP02675 491 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PFKMP08237 780 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 BMP3P12645 472 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms