RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	SCNN1G	P51170	649 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	KYAT1	Q16773	422 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	HCST	Q9UBK5	93 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	CLIC2	O15247	247 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	MBD3	O95983	291 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	CLTA	P09496	248 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	LAG3	P18627	525 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	HOXD13	P35453	343 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	TNFSF9	P41273	254 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	ACOT2	P49753	483 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	ERVK-21	P61565	698 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	SPRED2	Q7Z698	418 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	CWH43	Q9H720	699 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	MYH11	P35749	1972 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM34-208	ENST00000485019	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	BIN1	O00499	593 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	TH	P07101	528 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	CXCL8	P10145	99 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	ADSS	P30520	456 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	BMPR1A	P36894	532 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	GRIK3	Q13003	919 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019		Q7L0L9	218 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	PTGES	O14684	152 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	INPPL1	O15357	1258 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	DDHD2	O94830	711 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	ALDH2	P05091	517 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	RB1	P06400	928 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	PBX3	P40426	434 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	OR1G1	P47890	313 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	CYP2J2	P51589	502 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	BCAR1	P56945	870 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	STIM1	Q13586	685 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	SNX27	Q96L92	541 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM34-208	ENST00000485019	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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