RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SWAP70Q9UH65 585 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC37A3O60309 1634 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF1AQ12756 1690 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SBNO1A3KN83 1393 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 FLT4P35916 1363 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF24Q5T7B8 1368 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAMEF25A6NGN4 478 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 EFEMP2O95967 443 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV1-40P01703 118 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MMEP08473 750 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 BCAR1P56945 870 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK17Q00537 523 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX17Q15036 470 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ELF2Q15723 593 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH1L2Q3SY69 923 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP4F22Q6NT55 531 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC174Q6PII3 467 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2C3Q8N628 320 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LZTR1Q8N653 840 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB15Q8WXK1 588 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP6Q96JE9 813 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 GBP4Q96PP9 640 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS11Q9H270 941 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LRCH1Q9Y2L9 728 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQY0 241 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NOTOA8MTQ0 251 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ACOT7O00154 380 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MAFKO60675 156 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 APOL3O95236 402 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NTRK1P04629 796 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MSL3P1P0C860 447 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 FBLN1P23142 703 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFSF4P23510 183 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CHKAP35790 457 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 GATA4P43694 442 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 GSK3AP49840 483 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CASP5P51878 434 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CORO7P57737 925 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MYBPC3Q14896 1274 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ANO4Q32M45 955 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC38Q5R3I4 469 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MAEAQ7L5Y9 396 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 DAAM2Q86T65 1068 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SAPCD2Q86UD0 394 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NRG4Q8WWG1 115 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PHKBQ93100 1093 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 FERMT2Q96AC1 680 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ASIC4Q96FT7 647 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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