RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 USP17L19D6RCP7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L20D6RJB6 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ALAS1P13196 640 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 RARGP13631 454 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CTNNA2P26232 953 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CHRNA3P32297 505 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L24Q0WX57 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 BLMHQ13867 455 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SLMAPQ14BN4 828 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 LINGO3P0C6S8 592 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CBWD6Q4V339 395 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ART4Q93070 314 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 YIPF3Q9GZM5 350 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 AAASQ9NRG9 546 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 TP73O15350 636 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 GCNT3O95395 438 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 TGFB1I1O43294 461 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 LRRN2O75325 713 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 LLGL1Q15334 1064 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 STK33Q9BYT3 514 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.05■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SFI1A8K8P3 1242 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.04■■□□□ 1.12
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PMS1-222ENST00000639501 TNIP1Q15025 636 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.04■■□□□ 1.12
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PMS1-222ENST00000639501 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 BCS1LQ9Y276 419 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 GNPATO15228 680 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SNHG28P0DPA3 235 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ADCY1Q08828 1119 aa22.04■■□□□ 1.12
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PMS1-222ENST00000639501 KSR1Q8IVT5 923 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CKAP2Q8WWK9 683 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SAAL1Q96ER3 474 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD62A6NC57 917 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L10C9JJH3 530 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 O00370 1275 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 PODXLO00592 558 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 TRIM49P0CI25 452 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 TRIM49CP0CI26 452 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 PYGMP11217 842 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CHKAP35790 457 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 GSTO1P78417 241 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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PMS1-222ENST00000639501 TAF11Q15544 211 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CROCCP2Q86T23 111 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 IFT74Q96LB3 600 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 PARP2Q9UGN5 583 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CCNB1P14635 433 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 TNFAIP3P21580 790 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 FMO5P49326 533 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.03■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.03■■□□□ 1.12
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