RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM237Q96Q45 408 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZBTB43O43298 467 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 STRNO43815 780 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 UNC5CO95185 931 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ETS2P15036 469 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RTP1P59025 263 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CAMK2BQ13554 666 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MORC3Q14149 939 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FNDC8Q8TC99 324 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ISCUQ9H1K1 167 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC160A6NGH7 325 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZBED4O75132 1171 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 APOEP02649 317 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PDE6AP16499 860 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 HERVK_113P62684 666 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RESP18Q5W5W9 173 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 LPIN2Q92539 896 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 NDC80O14777 642 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GLI1P08151 1106 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 EPHX2P34913 555 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CDK17Q00537 523 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PPARDQ03181 441 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PPARAQ07869 468 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 FSTL1Q12841 308 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGEF6Q15052 776 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CHADLQ6NUI6 762 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 NUP93Q8N1F7 819 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DDHD1Q8NEL9 900 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 EPSTI1Q96J88 318 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 UBAC1Q9BSL1 405 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MTMR7Q9Y216 660 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RPS8P62241 208 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC34A1Q06495 639 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DOK7Q18PE1 504 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA5Q8NB90 893 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CHP1Q99653 195 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ECE2O60344 883 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 ALDH2P05091 517 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC159P0C7I6 412 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT4P19013 534 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 BCAMP50895 628 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 PLCB3Q01970 1234 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 AP1B1Q10567 949 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 28
EFTUD2-218ENST00000590367 GRAPQ13588 217 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-218ENST00000590367 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms