RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 INSRP06213 1382 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PLIN1O60240 522 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 KDM1AO60341 852 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 GJA4P35212 333 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ECE1P42892 770 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 NR1I3Q14994 352 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.315e-7■■■■□ 20
PTPRM-208ENST00000578600 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 TTLL6Q8N841 843 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 KIRREL1Q96J84 757 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 WDR90Q96KV7 1748 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 F8W031 263 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 H0YIN7 160 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PEX14O75381 377 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PF4V1P10720 104 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 RBP3P10745 1247 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 GYS1P13807 737 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SDHBP21912 280 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 SDHAP31040 664 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 HTRA3P83110 453 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 TCIRG1Q13488 830 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC32Q14392 662 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ACAP2Q15057 778 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 RPTNQ6XPR3 784 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 LDHDQ86WU2 507 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 ABHD8Q96I13 439 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-208ENST00000578600 FLT4P35916 1363 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 CNTNAP1P78357 1384 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 KLHL33A6NCF5 533 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 ACOT7O00154 380 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 CYP27B1O15528 508 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 MPOP05164 745 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 KCNA3P22001 575 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 SLC9A5Q14940 896 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM240Q5SV17 173 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 CPA6Q8N4T0 437 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 ACAP3Q96P50 834 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 ZMAT4Q9H898 229 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 INVSQ9Y283 1065 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 LY75O60449 1722 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM75PA6NK02 468 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 RASSF10A6NK89 507 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 FZD9O00144 591 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 FOXN1O15353 648 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 IL33O95760 270 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 VCAM1P19320 739 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PDE6BP35913 854 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 MAPKAPK2P49137 400 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 FNTBP49356 437 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 KRT85P78386 507 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PRR5P85299 388 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 ADCY1Q08828 1119 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 ADGRF1Q5T601 910 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 C16orf92Q96LL3 132 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 MSRAQ9UJ68 235 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 MEGF6O75095 1541 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 NUDT19A8MXV4 375 aa6.81□□□□□ -1.32
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