RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 AMHR2Q16671 573 aa20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM187BQ17R55 369 aa20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 KIFAP3Q92845 792 aa20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 CSRNP2Q9H175 543 aa20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 CLDND1Q9NY35 253 aa20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 DNM3Q9UQ16 869 aa20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM50BQ9Y247 325 aa20.43■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 FSCN2O14926 492 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC26A4O43511 780 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 IRS1P35568 1242 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 NAMPTP43490 491 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 IL17AQ16552 155 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 HACE1Q8IYU2 909 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 URGCPQ8TCY9 931 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 LPPQ93052 612 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 RSAD1Q9HA92 442 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.42■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 INPPL1O15357 1258 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 EYA4O95677 639 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 BCAR1P56945 870 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 ADAM15Q13444 863 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 HYIQ5T013 277 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 EFHBQ8N7U6 833 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 FZD8Q9H461 694 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 STK39Q9UEW8 545 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.41■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A1B0GUA9 196 aa20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 ITGA4P13612 1032 aa20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 IFT74Q96LB3 600 aa20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 AK8Q96MA6 479 aa20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 IPPQ9Y573 584 aa20.4■□□□□ 0.86
TSPAN4-216ENST00000526055 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 LTBRP36941 435 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 EFNA5P52803 228 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ERVFC1P60507 584 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 MAPK6Q16659 721 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 DEPTORQ8TB45 409 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM169Q96HH4 297 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CPB2Q96IY4 423 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TIPINQ9BVW5 301 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TLE6Q9H808 572 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.39■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NRIP1P48552 1158 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 LONRF3Q496Y0 759 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 BSNDQ8WZ55 320 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TCF25Q9BQ70 676 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 IGFLR1Q9H665 355 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.38■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PP2D1A8MPX8 630 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 N4BP3O15049 544 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CSPG5O95196 566 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 GALTP07902 379 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PBX3P40426 434 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 DUSP6Q16828 381 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 TMC7Q7Z402 723 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 DRC1Q96MC2 740 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.37■□□□□ 0.85
TSPAN4-216ENST00000526055 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms