RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 SIX5Q8N196 739 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 RMDN1Q96DB5 314 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 IGSF21Q96ID5 467 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM167AQ96KS9 214 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 SMCO2A6NFE2 343 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 PSAPP07602 524 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 GPC3P51654 580 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNG4Q8TDN1 519 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 WNT16Q9UBV4 365 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 WDR81Q562E7 1941 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 CYP3A4P08684 503 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 MICU3Q86XE3 530 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 CHST12Q9NRB3 414 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 BARHL2Q9NY43 387 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 GALTP07902 379 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 PHKA2P46019 1235 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 PTPN14Q15678 1187 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 LETM2Q2VYF4 491 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 SCLT1Q96NL6 688 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 STK39Q9UEW8 545 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 SKIP12755 728 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 FGFR4P22455 802 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 CLCN4P51793 760 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 FUT2Q10981 343 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PACSIN3-206ENST00000530405 STK25O00506 426 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 OATP04181 439 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 CDC42EP1Q00587 391 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 NOMO2Q5JPE7 1267 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 KIAA2013Q8IYS2 634 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 NLRP7Q8WX94 980 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 VN1R3Q9BXE9 311 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 SAMM50Q9Y512 469 aa18.45■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 KRBA1A5PL33 1030 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF862O60290 1169 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 CFHP08603 1231 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 KLRC2P26717 231 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 APOA5Q6Q788 366 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 R4GN57 208 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 NCOR2Q9Y618 2525 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 FANCMQ8IYD8 2048 aa18.44■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 WDR64B1ANS9 1081 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC27A2O14975 620 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 LILRB3O75022 631 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF623O75123 536 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 CNPP09543 421 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC11A1P49279 550 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 PRKCEQ02156 737 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 LPPQ93052 612 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 NXPE3Q969Y0 559 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 DNAJB4Q9UDY4 337 aa18.43■□□□□ 0.54
PACSIN3-206ENST00000530405 CEP250Q9BV73 2442 aa18.43■□□□□ 0.54
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