RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394456.9

GTF2F1-201, Transcript of general transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2F1, Length 2,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1-201ENST00000394456 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 ACP6Q9NPH0 428 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 BACH1O14867 736 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 TBX3O15119 743 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 TTI1O43156 1089 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 DAPK3O43293 454 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 OPA1O60313 960 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 PSMD10O75832 226 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 H2AFZP0C0S5 128 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 TNIP1Q15025 636 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 CHADLQ6NUI6 762 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 H2AFVQ71UI9 128 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 PRKCIP41743 596 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 PRELPP51888 382 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 CORO7P57737 925 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 MTFR1LQ9H019 292 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 FZD1Q9UP38 647 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 F8VZ95 297 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 KRIT1O00522 736 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 CYP3A4P08684 503 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 HSD17B3P37058 310 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 FMO5P49326 533 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 CPXCR1Q8N123 301 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 HOOK2Q96ED9 719 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 FAM84AQ96KN4 292 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 FEM1BQ9UK73 627 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 COG5Q9UP83 839 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 LIG3P49916 1009 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 MAP3K10Q02779 954 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 FAM160B2Q86V87 743 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 DAW1Q8N136 415 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 KAT5Q92993 513 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 RNF14Q9UBS8 474 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 FLOT1O75955 427 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 TNNC1P63316 161 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 ODR4Q5SWX8 454 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 IL31RAQ8NI17 732 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 FAM107BQ9H098 131 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 THAP2Q9H0W7 228 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 HACL1Q9UJ83 578 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2F1-201ENST00000394456 GAS7O60861 476 aa14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 LLGL1Q15334 1064 aa14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 RUBCNQ92622 972 aa14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 PARVGQ9HBI0 331 aa14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.65□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 ZNF536O15090 1300 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 NFIBO00712 420 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 SOX5P35711 763 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 TRAF1Q13077 416 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 30.2
GTF2F1-201ENST00000394456 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 FGGP02679 453 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 PTGER2P43116 358 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF2F1-201ENST00000394456 MARCKSL1P49006 195 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms