RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583826.5

TSPOAP1-AS1-209, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,004 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa32■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LMAN2LQ9H0V9 348 aa32■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 VPS54Q9P1Q0 977 aa32■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CSPG5O95196 566 aa31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TMX1Q9H3N1 280 aa31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EPHX3Q9H6B9 360 aa31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ZBTB42B2RXF5 422 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PSAPP07602 524 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 IL9P15248 144 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CIITAP33076 1130 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CRIPAKQ8N1N5 446 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NEK9Q8TD19 979 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PLVAPQ9BX97 442 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CDHR5Q9HBB8 845 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LRFN2Q9ULH4 789 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SAMM50Q9Y512 469 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa31.98■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RPS6KA5O75582 802 aa31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RUFY3Q7L099 469 aa31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PPP1R16BQ96T49 567 aa31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ERVK-5Q9HDB9 667 aa31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CLDND1Q9NY35 253 aa31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GABBR1Q9UBS5 961 aa31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 C22orf31O95567 290 aa31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EVCP57679 992 aa31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FAM178BQ8IXR5 827 aa31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TMEM40Q8WWA1 233 aa31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CD320Q9NPF0 282 aa31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KIAA1671Q9BY89 1806 aa31.96■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GRXCR2A6NFK2 248 aa31.95■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NLRP5P59047 1200 aa31.95■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 METTL13Q8N6R0 699 aa31.95■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP31.95■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LENG9Q96B70 501 aa31.95■■■□□ 2.71
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MMP1P03956 469 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SARSP49591 514 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GATMP50440 423 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 COL19A1Q14993 1142 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KIZQ2M2Z5 673 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ODR4Q5SWX8 454 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TRIM22Q8IYM9 498 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SH3GLB2Q9NR46 395 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PLAGL2Q9UPG8 496 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CEP131Q9UPN4 1083 aa31.94■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 DENND3A2RUS2 1198 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 WDR64B1ANS9 1081 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NCK2O43639 380 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MGEA5O60502 916 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GJD3Q8N144 294 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 P2RX5Q93086 422 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 OSMRQ99650 979 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa31.93■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GPR182O15218 404 aa31.92■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 VTNP04004 478 aa31.92■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 HYAL1Q12794 435 aa31.92■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FAM167AQ96KS9 214 aa31.92■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ADAM2Q99965 735 aa31.92■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 WDR81Q562E7 1941 aa31.92■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MSH4O15457 936 aa31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 NAALADL2Q58DX5 795 aa31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 DISC1Q9NRI5 854 aa31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 C1orf112Q9NSG2 853 aa31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FAM50BQ9Y247 325 aa31.91■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CPLX1O14810 134 aa31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CHMP2AO43633 222 aa31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 ITGB1P05556 798 aa31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 USP11P51784 963 aa31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 CLCN3P51790 818 aa31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 KLHL23Q8NBE8 558 aa31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 IGFLR1Q9H665 355 aa31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 RGS18Q9NS28 235 aa31.9■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 MAGEB2O15479 319 aa31.89■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 EDIL3O43854 480 aa31.89■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 GAS7O60861 476 aa31.89■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 SLC24A5Q71RS6 500 aa31.89■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 FAM228AQ86W67 206 aa31.89■■■□□ 2.7
TSPOAP1-AS1-209ENST00000583826 TBCKQ8TEA7 893 aa31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms