RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO10	Q9UK96	956 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	DVL2	O14641	736 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CUTA	O60888	179 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	IL18BP	O95998	194 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	COL6A1	P12109	1028 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ECE1	P42892	770 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	LSS	P48449	732 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	IL2	P60568	153 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ADCY1	Q08828	1119 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	BORA	Q6PGQ7	559 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	NXPE1	Q8N323	547 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	UBR7	Q8N806	425 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	USP7	Q93009	1102 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	FOXB1	Q99853	325 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	OR10A5	Q9H207	317 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MROH6	A6NGR9	719 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MPIG6B	O95866	241 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CPE	P16870	476 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	SLC9A1	P19634	815 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	NFKB2	Q00653	900 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ROM1	Q03395	351 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	STIL	Q15468	1287 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	TOMM22	Q9NS69	142 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ZEB2	O60315	1214 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	NOBOX	O60393	691 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL18	O94889	574 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	FKBP9	O95302	570 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	CD40	P25942	277 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	IL13RA1	P78552	427 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MAP3K12	Q12852	859 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	TTC38	Q5R3I4	469 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	GPR158	Q5T848	1215 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	C7orf31	Q8N865	590 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	TTC1	Q99614	292 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	AMN	Q9BXJ7	453 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	IFT22	Q9H7X7	185 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		5.72	□□□□□ -1.49
CLK1-208	ENST00000464454	MAFG	O15525	162 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	BRINP1	O60477	761 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	PRL	P01236	227 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	INHBB	P09529	407 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	BPI	P17213	487 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	POLD1	P28340	1107 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	PHC1	P78364	1004 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	NFATC3	Q12968	1075 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	LRRC32	Q14392	662 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454		Q6ZUG5	572 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	SYT8	Q8NBV8	401 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	MAML3	Q96JK9	1138 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	MCM8	Q9UJA3	840 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	LSP1	P33241	339 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	SLC6A3	Q01959	620 aa		5.7	□□□□□ -1.5
CLK1-208	ENST00000464454	SURF1	Q15526	300 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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