RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFI1A8K8P3 1242 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFA10O95299 355 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSCAN26Q16670 478 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1328Q86T90 577 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMNQ9BXJ7 453 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGL1Q9NZL6 768 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP25P42331 645 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC122Q5T0U0 273 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR8K1Q8NGG5 319 aa17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MACROD2A1Z1Q3 448 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHOBTB3O94955 611 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VIL1P09327 827 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF76P36508 570 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MKL1Q969V6 931 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GMLQ99445 158 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC10BA6NIK2 292 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDYE3A6NKU9 549 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD65E5RJM6 399 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAD1O00515 517 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHACTR2O75167 634 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMARCA1P28370 1054 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASA3Q14644 834 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTI2Q6NXR4 508 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTMR8Q96EF0 704 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGBL1Q96MI9 1066 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUSP10Q9Y6W6 482 aa17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LGALS16A8MUM7 142 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZMYND10O75800 440 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUPT20HQ8NEM7 779 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIGOQ8TEQ8 1089 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCAF4Q8WV16 495 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC51Q96ER9 411 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF341Q9BYN7 854 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITIH6Q6UXX5 1313 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTAGE15A4D2H0 777 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTAGE8P0CG41 777 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTAGE6Q86UF2 777 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTAGE4Q8IX94 777 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAD54LQ92698 747 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDAC9Q9UKV0 1011 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENTPD3O75355 529 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLD1P28340 1107 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAT2P52630 851 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTKN2Q8IZC4 609 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP112Q8N8E3 955 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P2RX5Q93086 422 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AK8Q96MA6 479 aa17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SORBS3O60504 671 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INPP5BP32019 993 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRELPP51888 382 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT26Q7Z3Y9 468 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUT8Q9BYC5 575 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCB6Q9NP58 842 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIM2Q9P1W9 311 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX10O60683 326 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT18P05783 430 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RSPH10BP0C881 870 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VSNL1P62760 191 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMB7Q99436 277 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO6Q9UM54 1294 aa17.18■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFKBIEO00221 500 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EML1O00423 815 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR59Q6PJI9 974 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAEAQ7L5Y9 396 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPBP1Q86WP2 473 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM151AQ8WW52 585 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JDP2Q8WYK2 163 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCAPGQ9BPX3 1015 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE11AQ9HCR9 933 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYOZ2Q9NPC6 264 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JRKLQ9Y4A0 524 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPHB6O15197 1021 aa17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KSR1Q8IVT5 923 aa17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms