RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 PLA2G6O60733 806 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 RASSF7Q02833 373 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 MTF1Q14872 753 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 CCDC125Q86Z20 511 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 MICALL2Q8IY33 904 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 TEPSINQ96N21 525 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 DESI2Q9BSY9 194 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 POTEFA5A3E0 1075 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 SLC26A4O43511 780 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 CYP3A4P08684 503 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 POTEIP0CG38 1075 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 PSMD2Q13200 908 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 TRIM14Q14142 442 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 POTEGQ6S5H5 508 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 POTEEQ6S8J3 1075 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 ERMNQ8TAM6 284 aa18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
TOM1-216ENST00000492723 B4DLN1 442 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 EHHADHQ08426 723 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 COASYQ13057 564 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 LRRC41Q15345 812 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 GPBP1Q86WP2 473 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CCDC51Q96ER9 411 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 PANK4Q9NVE7 773 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 UTRNP46939 3433 aa18.64■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 TUBB4AP04350 444 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 INPP5BP32019 993 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 LDHDQ86WU2 507 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 MEIS1O00470 390 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 DNM2P50570 870 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 UBXN2AP68543 259 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 RAD9BQ6WBX8 426 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 ABHD10Q9NUJ1 306 aa18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PQC6 194 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 KRT18P05783 430 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 DNAI1Q9UI46 699 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 VAV3Q9UKW4 847 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 ABCB11O95342 1321 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CYP11B2P19099 503 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 RPA1P27694 616 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 KRT9P35527 623 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CCDC65Q8IXS2 484 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 MYOCDQ8IZQ8 938 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 TBC1D7Q9P0N9 293 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 HACL1Q9UJ83 578 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.62■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 PTGER2P43116 358 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 PSMC6P62333 389 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 WDR18Q9BV38 432 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 DNM3Q9UQ16 869 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CCDC175P0C221 793 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 PRELPP51888 382 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 SLC12A3P55017 1021 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 LRRC63Q05C16 580 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 AGBL1Q96MI9 1066 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 DEFB129Q9H1M3 183 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 EHMT1Q9H9B1 1298 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CCPG1Q9ULG6 757 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.61■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 TTC26A0AVF1 554 aa18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 CYP4A11Q02928 519 aa18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.573e-6■□□□□ 9
TOM1-216ENST00000492723 DGKZQ13574 1117 aa18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 ZHX3Q9H4I2 956 aa18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 STK24Q9Y6E0 443 aa18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 FECHP22830 423 aa18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 ARSHQ5FYA8 562 aa18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 MIIPQ5JXC2 388 aa18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 TSG101Q99816 390 aa18.6■□□□□ 0.57
TOM1-216ENST00000492723 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms