RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621941.1

5S_rRNA.18-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 110 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KCNH3Q9ULD8 1083 aa2.34□□□□□ -2.03
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RNF112Q9ULX5 631 aa2.34□□□□□ -2.03
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF652Q9Y2D9 606 aa2.34□□□□□ -2.03
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 COQ6Q9Y2Z9 468 aa2.34□□□□□ -2.03
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MRFAP1Q9Y605 127 aa2.34□□□□□ -2.03
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FHOD1Q9Y613 1164 aa2.34□□□□□ -2.03
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ACTL7BQ9Y614 415 aa2.34□□□□□ -2.03
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa2.34□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MEGF11A6BM72 1044 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 VSTM5A8MXK1 200 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 H0Y8X5 98 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GABRDO14764 452 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GSTA4O15217 222 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NPHP1O15259 732 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SHOXO15266 292 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 XPOTO43592 962 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SH3BP5O60239 455 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LRRN2O75325 713 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ULK1O75385 1050 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PRKD3O94806 890 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 WISP1O95388 367 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ADAMTS2O95450 1211 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 IL33O95760 270 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PF4V1P10720 104 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NTF4P34130 210 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CAP2P40123 477 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SEPHS1P49903 392 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PICALMQ13492 652 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ACAP2Q15057 778 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NTRK3Q16288 839 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MINDY4Q4G0A6 757 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FAM47CQ5HY64 1035 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FAM102BQ5T8I3 360 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TPH2Q8IWU9 490 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 AMOTL1Q8IY63 956 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TCEAL8Q8IYN2 117 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DTWD1Q8N5C7 304 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SAMD3Q8N6K7 520 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MAGEB6Q8N7X4 407 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 C2orf69Q8N8R5 385 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GIMAP7Q8NHV1 300 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NEDD1Q8NHV4 660 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CHTF18Q8WVB6 975 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RNF141Q8WVD5 230 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ACDQ96AP0 544 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MDFIQ99750 246 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PHF20Q9BVI0 1012 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ASPNQ9BXN1 380 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PRDM10Q9NQV6 1147 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CHST7Q9NS84 486 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ATG3Q9NT62 314 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MKS1Q9NXB0 559 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MINPP1Q9UNW1 487 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FAM50BQ9Y247 325 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 BACE2Q9Y5Z0 518 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TNKSO95271 1327 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ASXL2Q76L83 1435 aa2.33□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 A0A0A0MRY4 1105 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PTPDC1A2A3K4 754 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FAM83GA6ND36 823 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 C2orf71A6NGG8 1288 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GOLGA8AA7E2F4 631 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GOLGA8BA8MQT2 603 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 WDR64B1ANS9 1081 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 OIP5O43482 229 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MYO1BO43795 1136 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RFPL1O75677 317 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PRAMEF1O95521 474 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 APBA3O96018 575 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 F2P00734 622 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CFBP00751 764 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FOSP01100 380 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GSNP06396 782 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 THBDP07204 575 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NFICP08651 508 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GSTM1P09488 218 aa2.32□□□□□ -2.04
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NID1P14543 1247 aa2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms