RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 PP2D1A8MPX8 630 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 LGALS16A8MUM7 142 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 SETDB2Q96T68 719 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 SBF2Q86WG5 1849 aa20.49■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 FGRP09769 529 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 IRAK1P51617 712 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 PLIN2Q99541 437 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 DEF6Q9H4E7 631 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 DISC1Q9NRI5 854 aa20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.47■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.47■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CCT5P48643 541 aa20.47■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.47■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.47■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CASZ1Q86V15 1759 aa20.47■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1328Q86T90 577 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CAGE1Q8TC20 777 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 B4DLN1 442 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF185O15231 689 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT83P78385 493 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM47Q96LD4 638 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.46■□□□□ 0.87
RALGPS1-208ENST00000424082 RCCD1A6NED2 376 aa20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 PPFIA1Q13136 1202 aa20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 LY75O60449 1722 aa20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PQC6 194 aa20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT86O43790 486 aa20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 KLK7P49862 253 aa20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.45■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP2D6P10635 497 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 C2orf54Q08AI8 447 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC51AQ86UW1 340 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 BLIDQ8IZY5 108 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 EBAG9O00559 213 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 KLRC4O43908 158 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 ERLIN2O94905 339 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.44■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO9A1A5B4 782 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 LIG3P49916 1009 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 MEA1Q16626 185 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC15Q8TF66 581 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 KAT2BQ92831 832 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 EHD4Q9H223 541 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GUL6 1792 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 RFC4P35249 363 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 MCTP2Q6DN12 878 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 THAP9Q9H5L6 903 aa20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 RASSF10A6NK89 507 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPY2A6NKD2 308 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMA7O14818 248 aa20.42■□□□□ 0.86
RALGPS1-208ENST00000424082 ORC4O43929 436 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms