RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497811.5

LINC00635-208, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00635, Length 856 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-208ENST00000497811 NLRX1Q86UT6 975 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 DIRC2Q96SL1 478 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.92□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 PPM1BO75688 479 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 RTP1P59025 263 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.91□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 CD3EP07766 207 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 IFNGR1P15260 489 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 POU4F1Q01851 419 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 NCAPHQ15003 741 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 KCNK12Q9HB15 430 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
LINC00635-208ENST00000497811 C8AP07357 584 aa8.89□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.89□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.89□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.89□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 B2RBV5 119 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 KIR3DS1Q14943 382 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 IRF2BP1Q8IU81 584 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 NAT16Q8N8M0 369 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 FAM84AQ96KN4 292 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.88□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 A0A1W2PQY0 241 aa8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 VAMP4O75379 141 aa8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 JMJD8Q96S16 334 aa8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 APBA2Q99767 749 aa8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.87□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 AURKAO14965 403 aa8.86□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 GRB10Q13322 594 aa8.86□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.86□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 KSR1Q8IVT5 923 aa8.86□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 STXBP3O00186 592 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 PNLIPP16233 465 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 FXNQ16595 210 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 PTCHD1Q96NR3 888 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 AKT3Q9Y243 479 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.85□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 NAT2P11245 290 aa8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 PDE6BP35913 854 aa8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 AMPD2Q01433 879 aa8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF124Q15973 351 aa8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 BVESQ8NE79 360 aa8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 SLC38A3Q99624 504 aa8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.84□□□□□ -0.99
LINC00635-208ENST00000497811 DDAH1O94760 285 aa8.83□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 PRKCAP17252 672 aa8.83□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 ADGRF1Q5T601 910 aa8.83□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.83□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.83□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 LGR4Q9BXB1 951 aa8.83□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 KCNH1O95259 989 aa8.82□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 SDHBP21912 280 aa8.82□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF605Q86T29 641 aa8.82□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.82□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 NUP43Q8NFH3 380 aa8.82□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.82□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 OR14I1A6ND48 311 aa8.81□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.81□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 KLF4O43474 513 aa8.81□□□□□ -1
LINC00635-208ENST00000497811 SUSD5O60279 629 aa8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms