RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDE4BQ07343 736 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM87BQ96K49 555 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUAK1O60285 661 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRMD6Q96NE9 622 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC26A8Q96RN1 970 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUSP13Q9UII6 198 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 GFRA2O00451 464 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 HPXP02790 462 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 LTKP29376 864 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNA15P30679 374 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 EGR3Q06889 387 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC6A19Q695T7 634 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF32Q9H0A6 362 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD320Q9NPF0 282 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-277P-201ENST00000516272 B8ZZF3 427 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 INHBBP09529 407 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLDCP23378 1020 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 LIG3P49916 1009 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRRG2O14669 202 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00310P59036 64 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF605Q86T29 641 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 OXR1Q8N573 874 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q96M66 194 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP131Q9UPN4 1083 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 MED14OSP0DP75 135 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLCG1P19174 1290 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNNI2P48788 182 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM13CQ8NE31 585 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 NCANO14594 1321 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 FITM1A5D6W6 292 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDE6BP35913 854 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTSWP56202 376 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAB4Q2WGN9 574 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 LILRA2Q8N149 483 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 DTWD2Q8NBA8 298 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 AK5Q9Y6K8 562 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 BPNT1O95861 308 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR160Q9UJ42 338 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 RLBP1P12271 317 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHMP4BP1P59074 171 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 DLG4P78352 724 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNA1Q09470 495 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRF2BP1Q8IU81 584 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRN2O75325 713 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRFP11831 508 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHRNEQ04844 493 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 DUSP4Q13115 394 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms