RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa6,68□□□□□ -1,34
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fsip2A2ARZ3 6995 aa6,61□□□□□ -1,35
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10100J3QK64 120 aa6,6□□□□□ -1,35
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lce1fB9EJP6 147 aa6,56□□□□□ -1,36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lce1a1Q9CQH5 143 aa6,56□□□□□ -1,36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10142J3KMP7 120 aa6,47□□□□□ -1,37
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lce3fQ6PAI4 98 aa6,32□□□□□ -1,4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sprr2hO70559 108 aa6,3□□□□□ -1,4
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lce3dE9Q8V1 98 aa6,25□□□□□ -1,41
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap4-7Q9D732 168 aa6,23□□□□□ -1,41
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lce1kJ3QP15 125 aa6,18□□□□□ -1,42
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A0A1Y7VJH8 109 aa6,06□□□□□ -1,44
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lce3aQ497I5 98 aa6,04□□□□□ -1,44
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa5,95□□□□□ -1,46
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap31-1Q9D644 177 aa5,78□□□□□ -1,48
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa4,97□□□□□ -1,61
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sprr2bO70554 98 aa4,3□□□□□ -1,72
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa4,26□□□□□ -1,73
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10229O08631 77 aa4,12□□□□□ -1,75
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa3,94□□□□□ -1,78
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phgr1Q8K0G7 91 aa3,71□□□□□ -1,82
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Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap6-2O08884 159 aa3,48□□□□□ -1,85
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap5-1Q64507 230 aa2,59□□□□□ -1,99
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm4559A4IF42 199 aa2,27□□□□□ -2,05
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