RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000074721.5

Hoxd8-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce3bQ9CQM7 98 aa10.36□□□□□ -0.75
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1a1Q9CQH5 143 aa10.29□□□□□ -0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm20538F6Z9R1 75 aa10.23□□□□□ -0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1kJ3QP15 125 aa10.21□□□□□ -0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr2iO70560 76 aa10.19□□□□□ -0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa10.15□□□□□ -0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11938Q9D3H4 131 aa10.06□□□□□ -0.8
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap9-1Q64526 186 aa9.93□□□□□ -0.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa9.83□□□□□ -0.84
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1cQ9D1C5 147 aa9.76□□□□□ -0.85
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce1eQ9D139 143 aa9.75□□□□□ -0.85
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11559Q9D3H7 191 aa9.68□□□□□ -0.86
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa9.56□□□□□ -0.88
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce3dE9Q8V1 98 aa9.35□□□□□ -0.91
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap19-4Q925H7 84 aa9.3□□□□□ -0.92
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa9.29□□□□□ -0.92
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm2431E9Q8S1 172 aa9.27□□□□□ -0.93
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa9.23□□□□□ -0.93
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce3eF8VQJ0 98 aa9.2□□□□□ -0.94
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lce3fQ6PAI4 98 aa9.2□□□□□ -0.94
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa9.16□□□□□ -0.94
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10100J3QK64 120 aa8.68□□□□□ -1.02
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A0A1Y7VLE6 161 aa8.65□□□□□ -1.02
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa8.63□□□□□ -1.03
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa8.53□□□□□ -1.04
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm9112A2AI92 75 aa8.53□□□□□ -1.04
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa8.5□□□□□ -1.05
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Muc19Q6PZE0 7524 aa8.44□□□□□ -1.06
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10142J3KMP7 120 aa8.39□□□□□ -1.07
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa8.27□□□□□ -1.08
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr2hO70559 108 aa8.18□□□□□ -1.1
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr2fO70557 76 aa7.87□□□□□ -1.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa7.83□□□□□ -1.16
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap4-16Q91W93 202 aa7.77□□□□□ -1.17
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa7.74□□□□□ -1.17
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 NebE9Q1W3 7152 aa7.73□□□□□ -1.17
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr2eO70556 76 aa7.71□□□□□ -1.17
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa7.56□□□□□ -1.2
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A0A1Y7VJ07 166 aa7.48□□□□□ -1.21
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa7.18□□□□□ -1.26
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1110025L11RikO09048 78 aa7.02□□□□□ -1.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap6-5Q925H3 78 aa7.02□□□□□ -1.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa6.94□□□□□ -1.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap31-1Q9D644 177 aa6.9□□□□□ -1.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Muc16A0A140LJ72 8478 aa6.73□□□□□ -1.33
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa6.68□□□□□ -1.34
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa6.57□□□□□ -1.36
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A0A286YCP9 139 aa6.34□□□□□ -1.39
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10229O08631 77 aa6.26□□□□□ -1.41
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap21-1Q925H4 128 aa5.72□□□□□ -1.49
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr2bO70554 98 aa5.69□□□□□ -1.5
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Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Phgr1Q8K0G7 91 aa4.89□□□□□ -1.63
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Krtap5-1Q64507 230 aa4.72□□□□□ -1.65
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm4559A4IF42 199 aa3.87□□□□□ -1.79
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