RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lce1dQ9D731 133 aa7,33□□□□□ -1,24
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lce1a1Q9CQH5 143 aa7,04□□□□□ -1,28
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10272F7CZ33 110 aa7,02□□□□□ -1,29
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa6,96□□□□□ -1,29
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap19-4Q925H7 84 aa6,81□□□□□ -1,32
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lce1cQ9D1C5 147 aa6,66□□□□□ -1,34
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa6,48□□□□□ -1,37
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eppk1Q8R0W0 6548 aa6,47□□□□□ -1,37
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa6,33□□□□□ -1,4
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lce3aQ497I5 98 aa6,03□□□□□ -1,44
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Muc19Q6PZE0 7524 aa6,01□□□□□ -1,45
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP5,87□□□□□ -1,47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hmcn1D3YXG0 5634 aa5,86□□□□□ -1,47
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa5,83□□□□□ -1,48
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa5,71□□□□□ -1,5
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP5,23□□□□□ -1,57
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa5,09□□□□□ -1,6
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa4,98□□□□□ -1,61
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa4,81□□□□□ -1,64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 A0A286YCP9 139 aa4,78□□□□□ -1,64
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1110025L11RikO09048 78 aa4,54□□□□□ -1,68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap6-5Q925H3 78 aa4,54□□□□□ -1,68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sprr2bO70554 98 aa4,43□□□□□ -1,7
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa4,36□□□□□ -1,71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Muc16A0A140LJ72 8478 aa4,34□□□□□ -1,71
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa4,17□□□□□ -1,74
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm10229O08631 77 aa4,03□□□□□ -1,76
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm11567Q9D141 195 aa3,95□□□□□ -1,78
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Phgr1Q8K0G7 91 aa3,72□□□□□ -1,81
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap6-2O08884 159 aa3,43□□□□□ -1,86
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krtap5-1Q64507 230 aa3,3□□□□□ -1,88
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4559A4IF42 199 aa2,43□□□□□ -2,02
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