RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm11595B1AQA7 289 aa6,78□□□□□ -1,32
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap4-8B1AQA8 209 aa6,78□□□□□ -1,32
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sprr2iO70560 76 aa6,72□□□□□ -1,33
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sprr2hO70559 108 aa6,67□□□□□ -1,34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lce3cQ91V05 98 aa6,65□□□□□ -1,34
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fsip2A2ARZ3 6995 aa6,62□□□□□ -1,35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lce3dE9Q8V1 98 aa6,61□□□□□ -1,35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap4-9B1AQA9 244 aa6,6□□□□□ -1,35
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mt4P47945 62 aa6,58□□□□□ -1,36
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sprr2eO70556 76 aa6,55□□□□□ -1,36
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lce3fQ6PAI4 98 aa6,52□□□□□ -1,37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap4-7Q9D732 168 aa6,46□□□□□ -1,37
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sprr2kO70562 68 aa6,46□□□□□ -1,38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2300003K06RikA2A4M0 262 aa6,44□□□□□ -1,38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP6,41□□□□□ -1,38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sprr2fO70557 76 aa6,37□□□□□ -1,39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa6,37□□□□□ -1,39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lce1bQ9D149 137 aa6,37□□□□□ -1,39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lce3aQ497I5 98 aa6,36□□□□□ -1,39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa6,35□□□□□ -1,39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A0A1Y7VJH8 109 aa6,28□□□□□ -1,4
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mt1P02802 61 aaKnown RBP6,17□□□□□ -1,42
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa6,07□□□□□ -1,44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lce1lQ9D1G7 135 aa6,06□□□□□ -1,44
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa6,02□□□□□ -1,45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lce1kJ3QP15 125 aa6,02□□□□□ -1,45
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap4-16Q91W93 202 aa5,84□□□□□ -1,47
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm11568A2A4M2 211 aa5,82□□□□□ -1,48
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap9-1Q64526 186 aa5,82□□□□□ -1,48
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa5,72□□□□□ -1,49
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A0A1Y7VLE6 161 aa5,7□□□□□ -1,5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa5,69□□□□□ -1,5
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa5,63□□□□□ -1,51
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa5,56□□□□□ -1,52
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa5,56□□□□□ -1,52
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa5,55□□□□□ -1,52
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa5,53□□□□□ -1,52
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mt3P28184 68 aa5,4□□□□□ -1,54
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP5,36□□□□□ -1,55
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm11559Q9D3H7 191 aa5,3□□□□□ -1,56
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa5,21□□□□□ -1,58
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa5,14□□□□□ -1,59
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm2431E9Q8S1 172 aa5,08□□□□□ -1,6
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A0A286YCP9 139 aa5,07□□□□□ -1,6
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hmcn1D3YXG0 5634 aa5,05□□□□□ -1,6
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa5,03□□□□□ -1,6
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa5,01□□□□□ -1,61
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eppk1Q8R0W0 6548 aa4,98□□□□□ -1,61
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Muc16A0A140LJ72 8478 aa4,97□□□□□ -1,61
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa4,92□□□□□ -1,62
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa4,92□□□□□ -1,62
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Muc19Q6PZE0 7524 aa4,78□□□□□ -1,64
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 1110025L11RikO09048 78 aa4,77□□□□□ -1,65
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap6-5Q925H3 78 aa4,77□□□□□ -1,65
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa4,72□□□□□ -1,65
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A0A1Y7VJ07 166 aa4,72□□□□□ -1,65
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa4,69□□□□□ -1,66
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP4,67□□□□□ -1,66
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa4,65□□□□□ -1,67
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sprr2bO70554 98 aa4,49□□□□□ -1,69
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NebE9Q1W3 7152 aa4,36□□□□□ -1,71
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP4,33□□□□□ -1,72
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP4,32□□□□□ -1,72
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa4,22□□□□□ -1,73
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10229O08631 77 aa4,2□□□□□ -1,74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap21-1Q925H4 128 aa3,94□□□□□ -1,78
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm11567Q9D141 195 aa3,94□□□□□ -1,78
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Phgr1Q8K0G7 91 aa3,92□□□□□ -1,78
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa3,83□□□□□ -1,8
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap6-2O08884 159 aa3,5□□□□□ -1,85
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krtap5-1Q64507 230 aa2,57□□□□□ -2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm4559A4IF42 199 aa2,3□□□□□ -2,04
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