RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa3.91□□□□□ -1.78
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11596B1AQB0 205 aa3.83□□□□□ -1.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10100J3QK64 120 aa3.76□□□□□ -1.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lce1kJ3QP15 125 aa3.72□□□□□ -1.81
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap22-2J3QNX6 67 aa3.7□□□□□ -1.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap4-9B1AQA9 244 aa3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm2431E9Q8S1 172 aa3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11564A2A4L9 201 aa3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11595B1AQA7 289 aa3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap4-8B1AQA8 209 aa3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10272F7CZ33 110 aa3.53□□□□□ -1.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sprr2gO70558 76 aa3.51□□□□□ -1.85
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lce1cQ9D1C5 147 aa3.5□□□□□ -1.85
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa3.49□□□□□ -1.85
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11554B1AQB2 190 aa3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lce1fB9EJP6 147 aa3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sprr2dO70555 85 aa3.48□□□□□ -1.85
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11938Q9D3H4 131 aa3.45□□□□□ -1.86
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa3.4□□□□□ -1.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11567Q9D141 195 aa3.39□□□□□ -1.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Syne1Q6ZWR6 8799 aa3.37□□□□□ -1.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa3.34□□□□□ -1.87
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mt4P47945 62 aa3.27□□□□□ -1.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap19-4Q925H7 84 aa3.27□□□□□ -1.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa3.25□□□□□ -1.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fsip2A2ARZ3 6995 aa3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lce3bQ9CQM7 98 aa3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eppk1Q8R0W0 6548 aa3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2300003K06RikA2A4M0 262 aa3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sprr2kO70562 68 aa3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10142J3KMP7 120 aa3.14□□□□□ -1.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sprr2iO70560 76 aa3.11□□□□□ -1.91
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lce3cQ91V05 98 aa3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa3.06□□□□□ -1.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lce3eF8VQJ0 98 aa3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lce3fQ6PAI4 98 aa3.05□□□□□ -1.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sprr2hO70559 108 aa3.03□□□□□ -1.92
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lce3dE9Q8V1 98 aa3.01□□□□□ -1.93
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mt1P02802 61 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sprr2fO70557 76 aa2.94□□□□□ -1.94
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11568A2A4M2 211 aa2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap9-1Q64526 186 aa2.93□□□□□ -1.94
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lce3aQ497I5 98 aa2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sprr2eO70556 76 aa2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap5-4Q62220 223 aa2.91□□□□□ -1.94
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa2.9□□□□□ -1.94
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa2.89□□□□□ -1.95
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap4-16Q91W93 202 aa2.81□□□□□ -1.96
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa2.78□□□□□ -1.97
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa2.77□□□□□ -1.97
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mt3P28184 68 aa2.64□□□□□ -1.99
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hmcn1D3YXG0 5634 aa2.59□□□□□ -2
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa2.58□□□□□ -2
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa2.58□□□□□ -2
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap5-5Q2TA51 241 aa2.58□□□□□ -2
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Muc16A0A140LJ72 8478 aa2.56□□□□□ -2
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa2.53□□□□□ -2
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Muc19Q6PZE0 7524 aa2.43□□□□□ -2.02
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap5-1Q64507 230 aa2.37□□□□□ -2.03
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1110025L11RikO09048 78 aa2.28□□□□□ -2.04
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap6-5Q925H3 78 aa2.28□□□□□ -2.04
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NebE9Q1W3 7152 aa2.26□□□□□ -2.05
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm4559A4IF42 199 aa2.26□□□□□ -2.05
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sprr2bO70554 98 aa2.03□□□□□ -2.09
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10229O08631 77 aa2.01□□□□□ -2.09
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap21-1Q925H4 128 aa1.89□□□□□ -2.11
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Phgr1Q8K0G7 91 aa1.79□□□□□ -2.12
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap6-2O08884 159 aa1.7□□□□□ -2.14
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