RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP7,98□□□□□ -1,13
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11595B1AQA7 289 aa7,98□□□□□ -1,13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-8B1AQA8 209 aa7,98□□□□□ -1,13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3cQ91V05 98 aa7,97□□□□□ -1,13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3eF8VQJ0 98 aa7,91□□□□□ -1,14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3fQ6PAI4 98 aa7,91□□□□□ -1,14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3dE9Q8V1 98 aa7,9□□□□□ -1,14
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A0A1Y7VJH8 109 aa7,66□□□□□ -1,18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2300003K06RikA2A4M0 262 aa7,61□□□□□ -1,19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa7,59□□□□□ -1,19
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2kO70562 68 aa7,47□□□□□ -1,21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1lQ9D1G7 135 aa7,47□□□□□ -1,21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa7,36□□□□□ -1,23
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap31-1Q9D644 177 aa7,33□□□□□ -1,24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-7Q9D732 168 aa7,31□□□□□ -1,24
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa6,95□□□□□ -1,3
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa6,87□□□□□ -1,31
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa6,71□□□□□ -1,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa6,67□□□□□ -1,34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mt3P28184 68 aa6,57□□□□□ -1,36
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hmcn1D3YXG0 5634 aa6,4□□□□□ -1,39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa6,32□□□□□ -1,4
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11559Q9D3H7 191 aa6,22□□□□□ -1,41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11554B1AQB2 190 aa6,14□□□□□ -1,43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm2431E9Q8S1 172 aa6,12□□□□□ -1,43
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa5,89□□□□□ -1,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa5,87□□□□□ -1,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A0A286YCP9 139 aa5,86□□□□□ -1,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A0A1Y7VJ07 166 aa5,84□□□□□ -1,47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Muc19Q6PZE0 7524 aa5,8□□□□□ -1,48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 1110025L11RikO09048 78 aa5,73□□□□□ -1,49
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa5,51□□□□□ -1,53
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa5,49□□□□□ -1,53
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa5,41□□□□□ -1,54
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eppk1Q8R0W0 6548 aa5,35□□□□□ -1,55
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP5,22□□□□□ -1,57
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2bO70554 98 aa5,16□□□□□ -1,58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10229O08631 77 aa5,06□□□□□ -1,6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NebE9Q1W3 7152 aa4,9□□□□□ -1,62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11567Q9D141 195 aa4,83□□□□□ -1,64
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa4,76□□□□□ -1,65
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phgr1Q8K0G7 91 aa4,63□□□□□ -1,67
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP4,63□□□□□ -1,67
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa4,59□□□□□ -1,67
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap6-2O08884 159 aa4,25□□□□□ -1,73
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap5-1Q64507 230 aa2,92□□□□□ -1,94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm4559A4IF42 199 aa2,79□□□□□ -1,96
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