RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11563B1AQ90 168 aa7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11595B1AQA7 289 aa7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-8B1AQA8 209 aa7.98□□□□□ -1.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3cQ91V05 98 aa7.97□□□□□ -1.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3eF8VQJ0 98 aa7.91□□□□□ -1.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3fQ6PAI4 98 aa7.91□□□□□ -1.14
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3dE9Q8V1 98 aa7.9□□□□□ -1.14
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1bQ9D149 137 aa7.83□□□□□ -1.16
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A0A1Y7VJH8 109 aa7.66□□□□□ -1.18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2300003K06RikA2A4M0 262 aa7.61□□□□□ -1.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa7.59□□□□□ -1.19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2eO70556 76 aa7.57□□□□□ -1.2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3aQ497I5 98 aa7.57□□□□□ -1.2
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2kO70562 68 aa7.47□□□□□ -1.21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1lQ9D1G7 135 aa7.47□□□□□ -1.21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa7.36□□□□□ -1.23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2fO70557 76 aa7.33□□□□□ -1.24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap31-1Q9D644 177 aa7.33□□□□□ -1.24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-7Q9D732 168 aa7.31□□□□□ -1.24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11568A2A4M2 211 aa7.16□□□□□ -1.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap9-1Q64526 186 aa7.16□□□□□ -1.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa7.05□□□□□ -1.28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A0A1Y7VLE6 161 aa7□□□□□ -1.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-16Q91W93 202 aa6.99□□□□□ -1.29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa6.95□□□□□ -1.3
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa6.87□□□□□ -1.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa6.85□□□□□ -1.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa6.84□□□□□ -1.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa6.77□□□□□ -1.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa6.71□□□□□ -1.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa6.67□□□□□ -1.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mt3P28184 68 aa6.57□□□□□ -1.36
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Muc16A0A140LJ72 8478 aa6.46□□□□□ -1.38
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa6.4□□□□□ -1.39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hmcn1D3YXG0 5634 aa6.4□□□□□ -1.39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa6.32□□□□□ -1.4
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa6.26□□□□□ -1.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa6.25□□□□□ -1.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11559Q9D3H7 191 aa6.22□□□□□ -1.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11554B1AQB2 190 aa6.14□□□□□ -1.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm2431E9Q8S1 172 aa6.12□□□□□ -1.43
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa5.89□□□□□ -1.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa5.87□□□□□ -1.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A0A286YCP9 139 aa5.86□□□□□ -1.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A0A1Y7VJ07 166 aa5.84□□□□□ -1.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Muc19Q6PZE0 7524 aa5.8□□□□□ -1.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 1110025L11RikO09048 78 aa5.73□□□□□ -1.49
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa5.51□□□□□ -1.53
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa5.49□□□□□ -1.53
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eppk1Q8R0W0 6548 aa5.35□□□□□ -1.55
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2bO70554 98 aa5.16□□□□□ -1.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10229O08631 77 aa5.06□□□□□ -1.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NebE9Q1W3 7152 aa4.9□□□□□ -1.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11567Q9D141 195 aa4.83□□□□□ -1.64
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa4.76□□□□□ -1.65
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phgr1Q8K0G7 91 aa4.63□□□□□ -1.67
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Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa4.59□□□□□ -1.67
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap6-2O08884 159 aa4.25□□□□□ -1.73
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap5-1Q64507 230 aa2.92□□□□□ -1.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm4559A4IF42 199 aa2.79□□□□□ -1.96
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