RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000017530.3

Traf4-201, Transcript of TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Traf4, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lce3bQ9CQM7 98 aa8,04□□□□□ -1,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap19-4Q925H7 84 aa8,03□□□□□ -1,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fsip2A2ARZ3 6995 aa7,96□□□□□ -1,13
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lce1fB9EJP6 147 aa7,83□□□□□ -1,16
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lce1a1Q9CQH5 143 aa7,83□□□□□ -1,16
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10100J3QK64 120 aa7,8□□□□□ -1,16
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa7,79□□□□□ -1,16
Traf4-201ENSMUST00000017530 2300003K06RikA2A4M0 262 aa7,77□□□□□ -1,17
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lce3cQ91V05 98 aa7,66□□□□□ -1,18
Traf4-201ENSMUST00000017530 Sprr2kO70562 68 aa7,65□□□□□ -1,18
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10142J3KMP7 120 aa7,63□□□□□ -1,19
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lce3eF8VQJ0 98 aa7,59□□□□□ -1,19
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lce3fQ6PAI4 98 aa7,59□□□□□ -1,19
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lce3dE9Q8V1 98 aa7,52□□□□□ -1,21
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap4-7Q9D732 168 aa7,5□□□□□ -1,21
Traf4-201ENSMUST00000017530 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP7,49□□□□□ -1,21
Traf4-201ENSMUST00000017530 Lce1kJ3QP15 125 aa7,48□□□□□ -1,21
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Traf4-201ENSMUST00000017530 Mt1P02802 61 aaKnown RBP7,39□□□□□ -1,23
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Traf4-201ENSMUST00000017530 Sprr2eO70556 76 aa7,07□□□□□ -1,28
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa6,8□□□□□ -1,32
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Traf4-201ENSMUST00000017530 Sprr2fO70557 76 aa6,7□□□□□ -1,34
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Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm11559Q9D3H7 191 aa6,5□□□□□ -1,37
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa6,49□□□□□ -1,37
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm2431E9Q8S1 172 aa6,35□□□□□ -1,39
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hmcn1D3YXG0 5634 aa6,34□□□□□ -1,39
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa6,32□□□□□ -1,4
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa6,3□□□□□ -1,4
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Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm11554B1AQB2 190 aa6,3□□□□□ -1,4
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap5-5Q2TA51 241 aa6,3□□□□□ -1,4
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap5-4Q62220 223 aa6,3□□□□□ -1,4
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap4-16Q91W93 202 aa6,3□□□□□ -1,4
Traf4-201ENSMUST00000017530 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa6,13□□□□□ -1,43
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa5,84□□□□□ -1,47
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Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa5,81□□□□□ -1,48
Traf4-201ENSMUST00000017530 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa5,8□□□□□ -1,48
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Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa5,44□□□□□ -1,54
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Traf4-201ENSMUST00000017530 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP5,28□□□□□ -1,56
Traf4-201ENSMUST00000017530 A0A1Y7VJ07 166 aa5,24□□□□□ -1,57
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa5□□□□□ -1,61
Traf4-201ENSMUST00000017530 Sprr2bO70554 98 aa5□□□□□ -1,61
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Traf4-201ENSMUST00000017530 NebE9Q1W3 7152 aa4,93□□□□□ -1,62
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm11567Q9D141 195 aa4,81□□□□□ -1,64
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa4,75□□□□□ -1,65
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP4,68□□□□□ -1,66
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap21-1Q925H4 128 aa4,61□□□□□ -1,67
Traf4-201ENSMUST00000017530 A0A286YCP9 139 aa4,44□□□□□ -1,7
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Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap6-2O08884 159 aa4,21□□□□□ -1,74
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa4,19□□□□□ -1,74
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa3,98□□□□□ -1,77
Traf4-201ENSMUST00000017530 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa3,85□□□□□ -1,79
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa3,82□□□□□ -1,8
Traf4-201ENSMUST00000017530 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa3,41□□□□□ -1,86
Traf4-201ENSMUST00000017530 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa3,26□□□□□ -1,89
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa3,24□□□□□ -1,89
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap5-1Q64507 230 aa2,93□□□□□ -1,94
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm4559A4IF42 199 aa2,74□□□□□ -1,97
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