RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 CHMLP26374 656 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 PRKG1Q13976 671 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 ALX1Q15699 326 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 WRNIP1Q96S55 665 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 APPP05067 770 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 C12orf60Q5U649 245 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 SWAP70Q9UH65 585 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 ZMYM6O95789 1325 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 TDO2P48775 406 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 CASC1Q6TDU7 716 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 MOB2Q70IA6 237 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 USP17L12C9JPN9 530 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 USP17L21D6R901 530 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 GABPAQ06546 454 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 CTR9Q6PD62 1173 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 NAPBQ9H115 298 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 PLCD1P51178 756 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-212ENST00000596309 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 SLC10A3P09131 477 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 MAP2K2P36507 400 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 NOGQ13253 232 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 VGLL4Q14135 290 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 ERO1BQ86YB8 467 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CAPNS2Q96L46 248 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 SKAP1Q86WV1 359 aa23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 PICK1Q9NRD5 415 aa23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 SIPA1L1O43166 1804 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 SGSM2O43147 1006 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CDC45O75419 566 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CAP2P40123 477 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 NT5C2P49902 561 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 HTRA3P83110 453 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 PPATQ06203 517 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 FZD1Q9UP38 647 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 OTOFQ9HC10 1997 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 ASNSP08243 561 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 INPP5BP32019 993 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 VEGFBP49765 207 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CYP4F22Q6NT55 531 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC17Q96LX7 622 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 DNAJC18Q9H819 358 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 FOXP2O15409 715 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 FGAP02671 866 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 VPS53Q5VIR6 699 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 SPRYD7Q5W111 196 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 WNK4Q96J92 1243 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 SHMT1P34896 483 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 INHBEP58166 350 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 PDE4BQ07343 736 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 PPIL2Q13356 520 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 ELP3Q9H9T3 547 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-212ENST00000596309 CEP350Q5VT06 3117 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-212ENST00000596309 CYP2D6P10635 497 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-212ENST00000596309 CDK8P49336 464 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-212ENST00000596309 PPARAQ07869 468 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-212ENST00000596309 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-212ENST00000596309 OPTNQ96CV9 577 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-212ENST00000596309 CABP5Q9NP86 173 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-212ENST00000596309 LAMB1P07942 1786 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-212ENST00000596309 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
FCHO1-212ENST00000596309 FAM196BA6NMK8 535 aa23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms