RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558836.5

CUX1-217, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CUX1, Length 2,965 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-217ENST00000558836 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX1-217ENST00000558836 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-217ENST00000558836 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-217ENST00000558836 CD164Q04900 197 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-217ENST00000558836 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CUX1-217ENST00000558836 PMAIP1Q13794 54 aa6.67□□□□□ -1.34
CUX1-217ENST00000558836 SERP2Q8N6R1 65 aa6.67□□□□□ -1.34
CUX1-217ENST00000558836 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.67□□□□□ -1.34
CUX1-217ENST00000558836 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.66□□□□□ -1.34
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CUX1-217ENST00000558836 C1orf137Q5JT78 98 aa6.66□□□□□ -1.34
CUX1-217ENST00000558836 A0A1W2PNM2 257 aa6.66□□□□□ -1.34
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CUX1-217ENST00000558836 TNP2Q05952 138 aa6.64□□□□□ -1.35
CUX1-217ENST00000558836 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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CUX1-217ENST00000558836 EPM2AB3EWF7 344 aa6.63□□□□□ -1.35
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CUX1-217ENST00000558836 C20orf197Q8N268 126 aa6.58□□□□□ -1.36
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CUX1-217ENST00000558836 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.51□□□□□ -1.37
CUX1-217ENST00000558836 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.51□□□□□ -1.37
CUX1-217ENST00000558836 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.51□□□□□ -1.37
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CUX1-217ENST00000558836 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.51□□□□□ -1.37
CUX1-217ENST00000558836 H0Y9J4 135 aa6.5□□□□□ -1.37
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CUX1-217ENST00000558836 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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CUX1-217ENST00000558836 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.43□□□□□ -1.38
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CUX1-217ENST00000558836 HCG22E2RYF7 251 aa6.4□□□□□ -1.38
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CUX1-217ENST00000558836 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.37□□□□□ -1.39
CUX1-217ENST00000558836 LINC00483Q53H64 154 aa6.36□□□□□ -1.39
CUX1-217ENST00000558836 KRTAP10-1P60331 282 aa6.36□□□□□ -1.39
CUX1-217ENST00000558836 IGLV7-43P04211 117 aa6.35□□□□□ -1.39
CUX1-217ENST00000558836 A8MWP4 228 aa6.34□□□□□ -1.39
CUX1-217ENST00000558836 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.34□□□□□ -1.39
CUX1-217ENST00000558836 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CUX1-217ENST00000558836 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.33□□□□□ -1.4
CUX1-217ENST00000558836 NDUFC1O43677 76 aa6.33□□□□□ -1.4
CUX1-217ENST00000558836 CASC2Q6XLA1 102 aa6.33□□□□□ -1.4
CUX1-217ENST00000558836 Q96NJ1 140 aa6.32□□□□□ -1.4
CUX1-217ENST00000558836 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CUX1-217ENST00000558836 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CUX1-217ENST00000558836 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.3□□□□□ -1.4
CUX1-217ENST00000558836 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.29□□□□□ -1.4
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