RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469653.5

SEMA4D-215, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

TSL 2

Gene SEMA4D, Length 3,533 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-215ENST00000469653 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.57□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 KLKP1Q107X0 134 aa6.57□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A096LNI7 61 aa6.56□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 BCE1O60756 84 aa6.56□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 IGLV6-57P01721 117 aa6.56□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 CXCL6P80162 114 aa6.55□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 SYCNQ0VAF6 134 aa6.55□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.55□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.55□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.53□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.53□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.53□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.53□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 C16orf90A8MZG2 172 aa6.53□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 LY6G6CO95867 125 aa6.53□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 LELP1Q5T871 98 aa6.53□□□□□ -1.36
SEMA4D-215ENST00000469653 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.52□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.52□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.51□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 PDE6GP18545 87 aa6.5□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 NREPQ16612 68 aa6.5□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 KMT2AQ03164 3969 aa6.5□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.5□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.49□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 CDK2AP2O75956 126 aa6.49□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.49□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 A6NN06 94 aa6.48□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 COX7BP24311 80 aa6.48□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 LCE6AA0A183 80 aa6.47□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.46□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SEMA4D-215ENST00000469653 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.46□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.46□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.46□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.46□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.46□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.46□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6ZRP5 223 aa6.46□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.46□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 PSCAO43653 123 aa6.45□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.45□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 PRR34Q9NV39 138 aa6.45□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 H3BQ85 93 aa6.45□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.45□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.44□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 NDUFC1O43677 76 aa6.44□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.44□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 IGKV4-1P06312 121 aa6.44□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.43□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 FAM168BA1KXE4 195 aa6.43□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 OCR1Q9BZK8 76 aa6.42□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6ZR54 194 aa6.41□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 SMIM29Q86T20 159 aa6.41□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 ERC2-IT1O76042 136 aa6.4□□□□□ -1.38
SEMA4D-215ENST00000469653 DNAH2Q9P225 4427 aa6.4□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 Q1T7F1 81 aa6.39□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 RYR2Q92736 4967 aa6.38□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.38□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 PRR15LQ9BU68 103 aa6.38□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.37□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.37□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.36□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 Q8N377 158 aa6.36□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 C15orf56Q8N910 161 aa6.36□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 PRLHP81277 87 aa6.35□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 CHTF8P0CG12 524 aa6.34□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 RYR3Q15413 4870 aa6.34□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SEMA4D-215ENST00000469653 RTL8CO15255 209 aa6.33□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 Q5VV11 94 aa6.33□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.32□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A1W2PNM2 257 aa6.32□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 C7orf33Q8WU49 177 aa6.32□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.32□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 C1orf137Q5JT78 98 aa6.32□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 K7EQZ3 153 aa6.31□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 MOBPQ13875 183 aa6.31□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 LUZP6Q538Z0 58 aa6.31□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 LINC00208Q96KT6 92 aa6.3□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.3□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.3□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A087WSZ3 146 aa6.29□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 Q9BRP9 147 aa6.29□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 hDV103S1A0JD37 113 aa6.28□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 CASC2Q6XLA1 102 aa6.28□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 PCOTHQ58A44 107 aa6.28□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.28□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 DSCR10P59022 87 aa6.28□□□□□ -1.4
SEMA4D-215ENST00000469653 A0A087WTM6 91 aa6.27□□□□□ -1.41
SEMA4D-215ENST00000469653 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SEMA4D-215ENST00000469653 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SEMA4D-215ENST00000469653 PKD1P98161 4303 aa6.26□□□□□ -1.41
SEMA4D-215ENST00000469653 Q6ZRX8 168 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms