RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568936.1

CCNDBP1-214, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-214ENST00000568936 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 LINC00575Q6W349 94 aa7.43□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 RTL8CO15255 209 aa7.42□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 CHTF8P0CG12 524 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 TNP2Q05952 138 aa7.41□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.41□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-214ENST00000568936 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.4□□□□□ -1.22
CCNDBP1-214ENST00000568936 hADV29S1A0JD25 119 aa7.4□□□□□ -1.22
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CCNDBP1-214ENST00000568936 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.4□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-214ENST00000568936 C16orf90A8MZG2 172 aa7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A1W2PNN7 141 aa7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-214ENST00000568936 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.37□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-214ENST00000568936 COX7BP24311 80 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 IMUPQ9GZP8 106 aa7.36□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 PKD1P98161 4303 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 CCKP06307 115 aa7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 GHRHP01286 108 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 KRTAP10-2P60368 255 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 LCE6AA0A183 80 aa7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q6ZQY7 126 aa7.34□□□□□ -1.23
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CCNDBP1-214ENST00000568936 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.32□□□□□ -1.24
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CCNDBP1-214ENST00000568936 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-214ENST00000568936 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.32□□□□□ -1.24
CCNDBP1-214ENST00000568936 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.32□□□□□ -1.24
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CCNDBP1-214ENST00000568936 PDE6GP18545 87 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q6ZQT0 140 aa7.28□□□□□ -1.24
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CCNDBP1-214ENST00000568936 PRYO14603 147 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 DSCR8Q96T75 97 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 DPH3Q96FX2 82 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.25□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-214ENST00000568936 REG3GQ6UW15 175 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q9BRP9 147 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 KRTAP10-1P60331 282 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 UBL5Q9BZL1 73 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.23□□□□□ -1.25
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CCNDBP1-214ENST00000568936 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 UBE2BP63146 152 aa7.21□□□□□ -1.25
CCNDBP1-214ENST00000568936 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 ERC2-IT1O76042 136 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 SVIPQ8NHG7 77 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 PKHD1P08F94 4074 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 HAMPP81172 84 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 PRLHP81277 87 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A1B0GVY2 172 aa7.18□□□□□ -1.26
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