RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483525.2

SAMMSON-201, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SAMMSON, Length 2,055 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-201ENST00000483525 V9GYY9 64 aa7.16□□□□□ -1.26
SAMMSON-201ENST00000483525 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.15□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.15□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 FAM168BA1KXE4 195 aa7.14□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 C7orf33Q8WU49 177 aa7.14□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.14□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 M0R2N4 97 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 hADV29S1A0JD25 119 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 C16orf90A8MZG2 172 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 SNCGO76070 127 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 Q6ZR54 194 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 TGP01266 2768 aa7.13□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 DNAH2Q9P225 4427 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 A0A096LNI7 61 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 COX7BP24311 80 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 XGP55808 180 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.12□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 MT-ATP8P03928 68 aa7.11□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.11□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.1□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.1□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.1□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.09□□□□□ -1.27
SAMMSON-201ENST00000483525 SPRR1AP35321 89 aa7.08□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.08□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.08□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.08□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 Q6ZQY7 126 aa7.08□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 A0A1W2PNN7 141 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 A0A087WTM6 91 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.07□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 H3BQ85 93 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 Q75L30 129 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 LY6G6CO95867 125 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.05□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.04□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 CHTF8P0CG12 524 aa7.04□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.04□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 ACYP1P07311 99 aa7.04□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 Q6Q795 121 aa7.04□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 Q6ZRX8 168 aa7.04□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.03□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.03□□□□□ -1.28
SAMMSON-201ENST00000483525 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.02□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 C3orf84H3BNL1 204 aa7.02□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 REG3GQ6UW15 175 aa7.02□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 Q9BRP9 147 aa7.02□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.02□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.01□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.01□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 PANO1I0J062 215 aa7□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 FRAS1Q86XX4 4008 aa7□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 EPM2AB3EWF7 344 aa6.99□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 RTL8CO15255 209 aa6.99□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 CCKP06307 115 aa6.99□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.99□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.97□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 Q8N377 158 aa6.97□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.97□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.96□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 Q6ZQT0 140 aa6.96□□□□□ -1.29
SAMMSON-201ENST00000483525 ERC2-IT1O76042 136 aa6.96□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.95□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 UBE2BP63146 152 aa6.95□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.95□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.95□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.94□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 DSCR8Q96T75 97 aa6.94□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 LINC00846Q9NV44 126 aa6.94□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.94□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 PDE6GP18545 87 aa6.94□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.94□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.93□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.93□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.93□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 DPH3Q96FX2 82 aa6.93□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.92□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 H0Y9J4 135 aa6.92□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 PRLHP81277 87 aa6.92□□□□□ -1.3
SAMMSON-201ENST00000483525 LINC00643Q86TS7 51 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms