RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 Q8N814 137 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 RMI2Q96E14 147 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 SIGMAR1Q99720 223 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 M0R378 163 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP10-2P60368 255 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 TGP01266 2768 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 MT-ATP8P03928 68 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 SCGB1A1P11684 91 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR1AP35321 89 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 NUPR2A6NF83 97 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 H3BS24 57 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 C7orf33Q8WU49 177 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 DNAH2Q9P225 4427 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 EPM2AB3EWF7 344 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 DNAL4O96015 105 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 ACYP1P07311 99 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 PCP4P48539 62 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 DIRC1Q969H9 104 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 hADV29S1A0JD25 119 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 FAM168BA1KXE4 195 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 COX7BP24311 80 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 GAGE2EQ4V326 116 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 Q6Q795 121 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 PRYO14603 147 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 TTC32Q5I0X7 151 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZR54 194 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-210ENST00000462363 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A096LNI7 61 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf90A8MZG2 172 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 B5MCH6 92 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 H3BQ85 93 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZQY7 126 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRC-210ENST00000462363 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZQT0 140 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00643Q86TS7 51 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRC-210ENST00000462363 Q9BRP9 147 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRC-210ENST00000462363 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRC-210ENST00000462363 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-210ENST00000462363 IMUPQ9GZP8 106 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRC-210ENST00000462363 PANO1I0J062 215 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRC-210ENST00000462363 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 PKD1P98161 4303 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 H0Y9J4 135 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 PSCAO43653 123 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 ERC2-IT1O76042 136 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 CHTF8P0CG12 524 aa3.53□□□□□ -1.84
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