RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296839.4

FOXQ1-201, Transcript of forkhead box Q1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXQ1, Length 2,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1-201ENST00000296839 C16orf90A8MZG2 172 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa16.74■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A1B0GV72 72 aa16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 RPL37AP8A6NKH3 93 aa16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 GAGE2AQ6NT46 116 aa16.73■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 M0R2N4 97 aa16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 H3BQ85 93 aa16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 PRYO14603 147 aa16.71■□□□□ 0.27
FOXQ1-201ENST00000296839 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa16.69■□□□□ 0.26
FOXQ1-201ENST00000296839 SCGB1A1P11684 91 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXQ1-201ENST00000296839 SPRR1AP35321 89 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXQ1-201ENST00000296839 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
FOXQ1-201ENST00000296839 C9orf163Q8N9P6 203 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXQ1-201ENST00000296839 GHRHP01286 108 aa16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa16.64■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A1W2PNN7 141 aa16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 SDIM1Q6ZPB5 146 aa16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 SMCR5Q8TEV8 140 aa16.63■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 B5MCH6 92 aa16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 CCKP06307 115 aa16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 Q6ZR54 194 aa16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 Q6ZRX8 168 aa16.62■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 FBN3Q75N90 2809 aa16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 RBM3P98179 157 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 PKIGQ9Y2B9 76 aa16.59■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 CHTF8P0CG12 524 aa16.58■□□□□ 0.25
FOXQ1-201ENST00000296839 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa16.58■□□□□ 0.24
FOXQ1-201ENST00000296839 Q9BRP9 147 aa16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1-201ENST00000296839 REG3GQ6UW15 175 aa16.56■□□□□ 0.24
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A087WTM6 91 aa16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1-201ENST00000296839 LINC00643Q86TS7 51 aa16.55■□□□□ 0.24
FOXQ1-201ENST00000296839 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa16.54■□□□□ 0.24
FOXQ1-201ENST00000296839 LINC00846Q9NV44 126 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1-201ENST00000296839 Q6ZQT0 140 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXQ1-201ENST00000296839 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
FOXQ1-201ENST00000296839 DSCR8Q96T75 97 aa16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 Q6Q795 121 aa16.5■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 LINC00474Q9P2X8 69 aa16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 LY6G6CO95867 125 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 KMT2AQ03164 3969 aa16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 PDE6GP18545 87 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 Q8N377 158 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 DEFB105AQ8NG35 78 aa16.46■□□□□ 0.23
FOXQ1-201ENST00000296839 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 UBE2BP63146 152 aa16.45■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 PANO1I0J062 215 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 C1orf134Q5TEV5 83 aa16.44■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 ERC2-IT1O76042 136 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 DNAH2Q9P225 4427 aa16.43■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 LINC00476Q8WZB0 136 aa16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 DNAH6Q9C0G6 4158 aa16.41■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa16.4■□□□□ 0.22
FOXQ1-201ENST00000296839 RTL8CO15255 209 aa16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 IMUPQ9GZP8 106 aa16.39■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 SPACA4Q8TDM5 124 aa16.38■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 Q6JHZ5 121 aa16.37■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 PRLHP81277 87 aa16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 DNAH17Q9UFH2 4485 aa16.36■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 TGP01266 2768 aa16.35■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 DPH3Q96FX2 82 aa16.34■□□□□ 0.21
FOXQ1-201ENST00000296839 EPM2AB3EWF7 344 aa16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 ALMS1Q8TCU4 4167 aa16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 C3orf22Q8N5N4 141 aa16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 UBL5Q9BZL1 73 aa16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 H0Y9J4 135 aa16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 C3orf84H3BNL1 204 aa16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 TNP2Q05952 138 aa16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 HIGD2AQ9BW72 106 aa16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1-201ENST00000296839 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1-201ENST00000296839 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa16.24■□□□□ 0.19
FOXQ1-201ENST00000296839 SMIM29Q86T20 159 aa16.23■□□□□ 0.19
FOXQ1-201ENST00000296839 Q6ZVQ6 151 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1-201ENST00000296839 BCE1O60756 84 aa16.22■□□□□ 0.19
FOXQ1-201ENST00000296839 UBE2AP49459 152 aa16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1-201ENST00000296839 ANAPC13Q9BS18 74 aa16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1-201ENST00000296839 C1orf137Q5JT78 98 aa16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1-201ENST00000296839 PLAC8Q9NZF1 115 aa16.17■□□□□ 0.18
FOXQ1-201ENST00000296839 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa16.16■□□□□ 0.18
FOXQ1-201ENST00000296839 FRAS1Q86XX4 4008 aa16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A1W2PNM2 257 aa16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1-201ENST00000296839 F8WEM9 126 aa16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1-201ENST00000296839 HAMPP81172 84 aa16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1-201ENST00000296839 SPRR1BP22528 89 aa16.1■□□□□ 0.17
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A087WVE0 104 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms