RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 COX7B2Q8TF08 81 aa7.13□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 F8VRH5 84 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 CXCL5P42830 114 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 SPATA45Q537H7 98 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.12□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PNN7 141 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKCP01834 107 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 DPM2O94777 84 aa7.11□□□□□ -1.27
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CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.11□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM223A0PJW6 202 aa7.1□□□□□ -1.27
CCL3L3-201ENST00000612839 TSTD3H0UI37 97 aa7.1□□□□□ -1.27
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CCL3L3-201ENST00000612839 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.08□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
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CCL3L3-201ENST00000612839 C7orf33Q8WU49 177 aa7.07□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 C14orf144Q96I85 54 aa7.07□□□□□ -1.28
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CCL3L3-201ENST00000612839 DDTP30046 118 aa7.06□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.06□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.05□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.05□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.05□□□□□ -1.28
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CCL3L3-201ENST00000612839 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.04□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 COX8AP10176 69 aa7.04□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 SFTA2Q6UW10 78 aa7.04□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 ERG28Q9UKR5 140 aa7.04□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PFN2P35080 140 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL3L3-201ENST00000612839 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 E9PLD3 99 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 NMUP48645 174 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PCP2Q8IVA1 136 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 MYCBP2O75592 4640 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 H3BS24 57 aa7.01□□□□□ -1.29
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CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.01□□□□□ -1.29
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CCL3L3-201ENST00000612839 DLEU1O43261 78 aa7□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 HERVK_113P61574 105 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 C22orf24Q9Y442 160 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 J3QQQ9 107 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 CTAG1AP78358 180 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 HERV-K104P63124 156 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A0U1RRA0 63 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SMIM13P0DJ93 91 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00158P58513 81 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL3L3-201ENST00000612839 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2BP63146 152 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 C1orf137Q5JT78 98 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8NDZ9 215 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF815PA8K554 130 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 VPREB1P12018 145 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 HIGD1BQ9P298 99 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00167Q96N53 147 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE10A6NGK3 116 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 M0R143 59 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV7-43P04211 117 aa6.92□□□□□ -1.3
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