RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BKO60814 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BJP06899 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BOP23527 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BBP33778 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BDP58876 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BCP62807 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 TPRXLQ17RH7 258 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.48□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 SERF1AO75920 110 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 CTAG1AP78358 180 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 PMCHL1Q16048 86 aa9.47□□□□□ -0.89
ITGA3-211ENST00000508100 HSBP1O75506 76 aa9.46□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM126AQ9H061 195 aa9.46□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM238C9JI98 176 aa9.45□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.45□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 VPREB1P12018 145 aa9.44□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFA6P56556 154 aa9.44□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 ERG28Q9UKR5 140 aa9.44□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.43□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.42□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 M0R378 163 aa9.42□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 IGLC3P0DOY3 106 aa9.42□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 COX17Q14061 63 aa9.42□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.42□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.42□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.41□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.41□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.4□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.4□□□□□ -0.9
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.39□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.39□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 LEPROTL1O95214 131 aa9.38□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 SFTA2Q6UW10 78 aa9.38□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.37□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.36□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00158P58513 81 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 Q8NDZ9 215 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 SPRR4Q96PI1 79 aa9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.34□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.34□□□□□ -0.91
ITGA3-211ENST00000508100 FABP4P15090 132 aa9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-211ENST00000508100 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ITGA3-211ENST00000508100 C11orf86A6NJI1 115 aa9.32□□□□□ -0.92
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0U1RRA0 63 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-211ENST00000508100 Q8NBF4 154 aa9.3□□□□□ -0.92
ITGA3-211ENST00000508100 DAND5Q8N907 189 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA3-211ENST00000508100 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.29□□□□□ -0.92
ITGA3-211ENST00000508100 MUC17Q685J3 4493 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-211ENST00000508100 PRYO14603 147 aa9.28□□□□□ -0.92
ITGA3-211ENST00000508100 H0Y8G0 127 aa9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 S100A6P06703 90 aa9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.27□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 SPINK1P00995 79 aa9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.26□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 PLNP26678 52 aa9.25□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.25□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 NCR3O14931 201 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 DPM2O94777 84 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 C3orf79P0CE67 100 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 SMIM13P0DJ93 91 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 S100A12P80511 92 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 LINC01545Q5VT33 79 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 PET117Q6UWS5 81 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.24□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM223A0PJW6 202 aa9.23□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 SPRR1AP35321 89 aa9.23□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.23□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 C5orf52A6NGY3 159 aa9.22□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 IGKCP01834 107 aa9.22□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 S100A2P29034 98 aa9.22□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.22□□□□□ -0.93
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00587B1AMM8 73 aa9.21□□□□□ -0.94
ITGA3-211ENST00000508100 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
ITGA3-211ENST00000508100 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.21□□□□□ -0.94
ITGA3-211ENST00000508100 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.21□□□□□ -0.94
ITGA3-211ENST00000508100 KRTDAPP60985 99 aa9.2□□□□□ -0.94
ITGA3-211ENST00000508100 HERV-K104P63124 156 aa9.2□□□□□ -0.94
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.19□□□□□ -0.94
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms