RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, human

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GARNL3-218	ENST00000487565	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565		A0A0J9YXY3	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	PFN2	P35080	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565		A0A0U1RRA0	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	DLEU1	O43261	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	TIMM17B	O60830	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	LINC00158	P58513	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	COX17	Q14061	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565		A0A1B0GVY2	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	PRY	O14603	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	PKD1	P98161	4303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	DAND5	Q8N907	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565		A0A096LNI7	61 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565		Q6ZRP5	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	LITAF	Q99732	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	NPC2	P61916	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565		Q6ZVH6	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	IFITM1	P13164	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	HSD52	Q0P140	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	PANO1	I0J062	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	TAL2	Q16559	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565		M0QXV9	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565		Q6ZSA8	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565		M0R143	59 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	NCR3	O14931	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	VPREB1	P12018	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	DDT	P30046	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GARNL3-218	ENST00000487565	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GARNL3-218	ENST00000487565		A0A087WYN8	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GARNL3-218	ENST00000487565	NDUFC2	O95298	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GARNL3-218	ENST00000487565	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GARNL3-218	ENST00000487565	CEND1	Q8N111	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GARNL3-218	ENST00000487565		Q8NDZ9	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GARNL3-218	ENST00000487565	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GARNL3-218	ENST00000487565	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GARNL3-218	ENST00000487565		A0A1W2PNN7	141 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GARNL3-218	ENST00000487565		A4D1N5	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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